Практическое занятие по эпидемиологии на примере распространения коронавируса COVID-19.

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ (греческий epidemos распространенный среди народа + logos учение) — медицинская наука, изучающая закономерности эпидемического процесса и разрабатывающая меры борьбы с заразными болезнями человека.

Как человек, не имеющий медицинского образования, я не буду растекаться мыслью по древу на тему мер борьбы с распространением коронавируса COVID-19 по странам и континентам. На АШ и в миру есть специалисты – если надо будет, подскажут, разъяснят и т.д.

Для меня более интересен (и доступен для изучения) вопрос изучения закономерности развития эпидемического процесса в разных странах. Источником информации является русскоязычный сайт https://coronavir.ru/category/hronika-sobytij/, в котором на ежедневной основе, начиная с 19 февраля 2020 года, публикуется статистика по заболевшим, умершим, выздоровевшим в разбивке по странам.

Преследуемая цель настоящим исследованием – получение, на основе обработки статистических данных, трендовых зависимостей для прогнозирования числа заболевших в разных странах. Практическое применение – скорее учебно-просветительская, для получения более-менее достоверных аргументов для спора между сторонниками идей - «мы все умрём» или «это всё фигня для обрушения рынков». Попутно можно будет выявить страны, где активно фильтруют информацию о количестве заражённых и/или просто забили болт на профилактику и диагностику данного заболевания.

Методология исследования.

Всё достаточно просто.

1. Ежедневные данные о количестве заражённых собираем в таблицы. Страны группируем по волнам заражения. Первая волна – это, собственно, Китай. Поскольку эпидемия в нём началась достаточно давно, то я, из-за ограниченности времени, не стал его вводить в исследование. Как развивался процесс в Китае можно посмотреть на сайте https://docs.google.com/spreadsheets/d/1f3LGuqwzegr7ZdGlzPOCDAyFk8RTaLTmMLF_K_5EVCc/htmlview?sle=true,  Вторая волна – это 4-е страны (Италия, Южная Корея, Иран, Япония), в которых количество заражённых начало активно расти с 19 февраля 2020 года. Таких стран, скорее всего, больше – в тех же Филиппинах китайцев более чем по много, однако, и заражённые там есть 100% - но официальная статистика в этих странах пока их не замечает. Это может быть следствием вообще слабой системы эпидемиологического контроля в этих странах. Не суть. Скоро всё узнаем. Третья волна – это, т.н. «растущие звёзды» - Бахрейн, Кувейт, Германия, Франция, Испания. Опять-таки, выделение только этих стран – следствие наличия в них развитой системы медицинской помощи населения, которая их диагностирует. Очевидно, что таковых стран больше.
2. Данные по количеству заражённых представляются в графическом виде. Графики динамики заражённых в абсолютных значениях не очень удобны для изучения, т.к. из-за эффекта масштаба меньшие значения сливаются и превращаются, зрительно, в прямую линию (см. рис. 1). Для борьбы с этим явлением используется старый проверенный способ представления данных в логарифмической шкале (y=ln(x), где х – число заражённых на конкретную дату, ln – натуральный логарифм). 
3. Аналогичные действия были проведены с показателями заражения стран третьей волны, результаты динамики в абсолютных цифрах представлены на рис. 2 
4. Сопоставление динамики стран 2-й и 3-й волн (в логарифмическом масштабе) представлено на рис. 3
5. Динамику роста количества заражённых в Китае я оцифрую на следующей неделе.
6. Примечание. Динамику смертей я делать пока не стал. Потом, как ни будь.

Выводы.

Полученные данные о динамике роста заражённых в странах 2-й и 3-й волн позволяют сделать следующие выводы

1. Логарифмическая шкала позволяет сопоставить динамику роста количества заражённых для стран, количество заражённых в которых различается в сотни раз.
2. Динамика роста заражённых для большинства стран в анализируемой выборке имеет общий характер и примерно равные темпы роста
3. Особо выделяется на фоне представленной выборки динамика роста заражённых в Японии. Страна имеет сопоставимую с Южной Кореей плотность населения, высокую суточную миграцию и т.д. Однако динамика крайне низкая и кардинально отличается от динамики других стран, что может быть обусловлено следующими причинами:

• Крайне эффективная система выявления и изолирования носителей короновируса. На мой взгляд, учитывая ситуацию с туристическим лайнером и информации СМИ – это крайне маловероятное событие.
• Крайне неэффективная система выявления и изолирования носителей короновируса. На мой взгляд, учитывая крайнюю тупизну властей в нестандартных ситуациях (а это – не стандартная ситуация) это вполне вероятно.
• Действия властей по сокрытию достоверной информации о количестве заражённых. На мой взгляд, учитывая уже озвученные угрозы по отмене летних ОИ, это версия выглядит наиболее правдоподобно.

4. Германия и Франция, вели себя достаточно похоже с Японией. Возможно, что просто не диагностировали новых заболевших (не искали, не там искали, не очень то и хотелось). Но, видимо количество жалоб/заражённых стало так велико, что они сломались и встали в общую струю.

После обработки данных по Китаю, можно будет, теоретически, делать более-менее долгосрочные прогнозы.

Рис.1 

Рис. 2

Рис. 3