Клё­со­вы тоже пой­дут на по­мой­ку, вслед за 23&Me

23andMe – пи­о­нер рынка пер­со­наль­ной ге­не­ти­ки – офи­ци­аль­но по­да­ла за­яв­ле­ние о банк­рот­стве. Та самая ком­па­ния, ко­то­рая пред­ла­га­ла каж­до­му «от­правь нам про­бир­ку со слю­ной – узна­ешь о себе всё» - те­перь офи­ци­аль­но всё.

Мне, как вы­чис­ли­тель­но­му био­ло­гу, од­но­вре­мен­но груст­но и зло­рад­но на­блю­дать эту си­ту­а­цию. Ведь идея-​то из­на­чаль­но была ре­во­лю­ци­он­ная! Мас­со­вый DNA-​тест за $99, ко­то­рый рас­ска­жет вам, что у вас 3% неан­дер­таль­ских генов и что ваш пра­пра­пра­дед был ви­кин­гом. Ваау, кто же не за­хо­чет узнать, не по­то­мок ли он Чин­гис­ха­на? Вдруг, на­след­ство какое по­ла­га­ет­ся?! 

На этой волне мил­ли­о­ны людей дей­стви­тель­но плю­ну­ли в про­бир­ку ради за­ба­вы. Но – по­дав­ля­ю­ще­му боль­шин­ству хва­ти­ло од­но­го раза. Вы­яс­ни­лось, что ши­ро­кая ауди­то­рия не го­нит­ся за про­сты­ми как ва­ле­нок ге­не­ти­че­ски­ми ин­сай­та­ми. Ну узнал ты од­на­жды, что тер­петь не мо­жешь кинзу из-за генов – и жи­вёшь даль­ше. Новых сен­са­ций сер­вис не вы­да­ёт, жиз­нен­но важ­ных со­ве­тов тоже нет. В ре­зуль­та­те удер­жа­ния ноль: 23andMe про­да­ла мил­ли­о­ны китов, но по­втор­но тот же кли­ент почти ни­ко­гда не воз­вра­щал­ся.

Тем вре­ме­нем на сцену вышли дру­гие иг­ро­ки, сде­ла­ли всё иначе – и пре­успе­ли. Возь­мём Tempus: ком­па­ния 2015 года , фокус – ге­но­ми­ка и дан­ные для кли­ник (осо­бен­но он­ко­ло­гия). Сей­час она стоит около $8 млрд, а её го­до­вая вы­руч­ка пе­ре­ва­ли­ла за $700 млн в 2024 (рост 30% в год). Они не про­да­ют ве­сё­лые от­чё­ты о про­ис­хож­де­нии, а по­мо­га­ют вра­чам под­би­рать ле­че­ние рака на ос­но­ве ге­не­ти­ки па­ци­ен­та. Ре­аль­ные боль­ни­цы, ре­аль­ные па­ци­ен­ты, по­сто­ян­ный поток новых дан­ных.

Или Caris Life Sciences – оцен­ка тоже под $8 млрд (по­след­ний раунд в 2021), огром­ные вло­же­ния в плат­фор­му мо­ле­ку­ляр­ной ди­а­гно­сти­ки. Caris с 2008 года на­ко­пи­ла базу из 450k+ про­фи­лей опу­хо­лей и пред­ла­га­ет вра­чам самый по­дроб­ный ана­лиз ДНК/РНК/бел­ков опу­хо­ли.

Эти ре­бя­та сразу вы­бра­ли дру­гой путь: ра­бо­тать для ме­ди­ци­ны, а не для празд­но­го лю­бо­пыт­ства. Клю­че­вое от­ли­чие от 23andMe в том, что Tempus и Caris из­на­чаль­но де­ла­ли став­ку на связ­ку с кли­ни­че­ски­ми дан­ны­ми, так как неоспо­ри­мый плюс па­ци­ен­та в кли­ни­ке - в том, что он пре­крас­но из­ме­рен и опи­сан со всех сто­рон.

И здесь-​то и кро­ет­ся глав­ная цен­ность ге­ном­ных дан­ных: они нужны толь­ко в связ­ке с ре­аль­ны­ми про­яв­ле­ни­я­ми (фе­но­ти­пом). Это вы­яс­ни­ла на своем пе­чаль­ном опыте ком­па­ния GSK, в 2018 ин­ве­сти­ро­вав $300 млн в 23andMe, и поняв спу­стя время, что голые ге­но­мы (вер­нее, даже ку­соч­ки ге­но­мов!) ни­ко­му даром не упали. Что толку от зна­ния о том, что бы­ва­ет такая бу­ков­ка в этой по­зи­ции ДНК, а бы­ва­ет дру­гая? Такое я и сам на­ге­не­ри­рую вам в эк­се­ле за пол­ча­са. Дру­гое дело - знать, что эта буква при­во­дит к таким-​то ре­аль­ным из­ме­не­ни­ям ор­га­низ­ма, а еще лучше бы это знать в ди­на­ми­ке.

Да, в 2005-м ге­не­ти­ка еще имела флер за­га­доч­но­сти, и можно было легко про­спе­ку­ли­ро­вать на ожи­да­ни­ях неда­ле­ких поль­зо­ва­те­лей. Да, имен­но так, по­то­му что по-​настоящему про­дви­ну­тые поль­зо­ва­те­ли сде­ла­ли себе ис­сле­до­ва­ние клю­че­вых по­ли­мор­физ­мов еще до 23эндМи, а затем про­сто сде­ла­ли себе пол­ный геном, и не ве­лись на мар­ке­тин­го­вые уве­ще­ва­ния, по­ку­пая это про­ме­жу­точ­ное ре­ше­ние a-la “ни к селу, ни к го­ро­ду”.

Или взять бизнес-​модель, ко­то­рая идет про­сто враз­рез с удер­жа­ни­ем поль­зо­ва­те­ля. Ладно там по­на­ча­лу они лили в уши на тему того, что мол “будет узна­вать­ся новая инфа - мы вам про­ап­дей­тим отчет, так что не за­би­вай­те на нас и не те­ряй­те па­роль, а оста­вай­тесь и за­хо­ди­те на сайт”. Но новые от­кры­тия уже стали про­ис­хо­дить за пре­де­ла­ми того ма­лень­ко­го фраг­мен­ти­ка ге­но­ма, ко­то­рый лю­без­но де­ла­ла вы­ше­на­зван­ная ком­па­ния. Да и сам отчет - это жал­кое по­до­бие того, что можно по­лу­чить из ДНК.

Сей­час я быст­рень­ко объ­яс­ню, что мы можем из генов по­лу­чать 2 клас­са ин­фор­ма­ции:

1) из­ме­не­ния ДНК, ко­то­рые ре­аль­но ведут к из­ме­не­нию свойств белка, ко­то­рый про­из­во­дит­ся по ко­ман­де (так на­зо­вем) этого гена. Да, каж­дый ген про­из­во­дит свой белок, а уже белок этот тво­рит дела в ор­га­низ­ме: пе­ре­да­ет сиг­на­лы, стро­ит ткани. И если белок ме­ня­ет­ся из-за из­ме­нен­ной ДНК - на­чи­на­ют­ся эф­фек­ты, на­при­мер сни­же­ние ка­че­ства крови, или за­мед­ле­ние ме­та­бо­лиз­ма каких-​либо мо­ле­кул. Вот, это как я на­зы­ваю "хо­ро­шие дан­ные".

Но об­суж­да­е­мая (и осуж­да­е­мая) нами ком­па­ния ос­нов­ной упор де­ла­ла на дан­ные типа 2) эге-​гей, ста­ти­сти­че­ские за­ви­си­мо­сти! Их об­на­ру­жи­ва­ют при­мер­но так: “О, гляди, ва­ри­а­ция в ге­но­ме! Не на­ру­ше­ние, не сни­же­ние или по­вы­ше­ние функ­ции белка, а имен­но ва­ри­а­ция. Типа, у од­но­го в этом месте бы­ва­ет так, у дру­го­го сяк, а у тре­тье­го на­пе­ре­ко­сяк. Мы фиг знаем что оно дает, но вот эти че­ли­ки с таким пат­тер­ном ДНК лю­би­ли яб­ло­ки, - зна­чит, и тебе ско­рее всего зай­дет!”

Этот класс дан­ных на­зы­ва­ет­ся GWAS (genome wide association studies), и это с точки зре­ния науки в боль­шин­стве слу­ча­ев пол­ная ерун­да. Не особо лучше чем, - помни­те, - были жу­ли­ки, ко­то­рые по от­пе­чат­ку паль­ца га­да­ли? Вот-​вот, и се­го­дня в адрес 23эндМи я вы­плес­ки­ваю часть непри­яз­ни, остав­шей­ся у меня в душе от тех про­хин­де­ев, ко­то­рые тоже дис­кри­ми­ни­ро­ва­ли ге­не­ти­ку. Так вот ком­па­нии, при­ве­зен­ные мной выше со зна­ком “плюс”, дают толь­ко пер­вый тип дан­ных.

Потом: окей, ну дали вы ему этот отчет: это вот тебе более по­лез­но, а это - менее. А он такой: “Да ну вас! Я это во­об­ще не люблю, а это на­обо­рот моя жизнь, ни за что не от­ка­жусь”. И вы­ки­нул отчет в по­мой­ку и ни­ко­гда не вер­нул­ся на сайт.

На­сто­я­щие ре­ко­мен­да­ции по ДНК в 2025 году могут вы­чис­лить им­пакт для раз­ных генов и раз­ных внеш­них воз­дей­ствий, во все­воз­мож­ных ком­би­на­ци­ях. Это я щас как вы­чис­ли­тель­ный био­лог го­во­рю, ко­то­рый на ра­бо­те про­гно­зи­ру­ет ре­зуль­та­ты кли­ни­че­ских ис­пы­та­ний новых ле­карств. Так что это вовсе не закат ин­ду­стрии, а про­сто де­мон­стра­ция того, как НЕ надо де­лать.

И се­го­дня ве­че­ром я выпью про­те­и­но­во­го кок­тей­ля за упо­кой полу-​шарлатанов 23andМе, ко­то­рые на­дол­го за­кре­пи­ли за собой в на­ро­де славу един­ствен­но­го стов­па ге­не­ти­ки, и в ре­зуль­та­те еще много-​много лет еван­ге­ли­стам и ви­зи­о­не­рам ге­ном­ных ис­сле­до­ва­ний при­дет­ся сти­рать языки, от­ве­чая на про­сто­душ­ные уточ­ня­ю­щие во­про­сы сла­бо­све­ду­щих обывателей-​толстолобиков: “О, клёво, а это как 23эндМи, да?”

                                                                        Дмит­рий Че­ба­нов, Лос Ан­жде­лес