Практическое занятие по эпидемиологии на примере распространения коронавируса COVID-19.

Аватар пользователя Нижегородец

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ (греческий epidemos распространенный среди народа + logos учение) — медицинская наука, изучающая закономерности эпидемического процесса и разрабатывающая меры борьбы с заразными болезнями человека.

Как человек, не имеющий медицинского образования, я не буду растекаться мыслью по древу на тему мер борьбы с распространением коронавируса COVID-19 по странам и континентам. На АШ и в миру есть специалисты – если надо будет, подскажут, разъяснят и т.д.

Для меня более интересен (и доступен для изучения) вопрос изучения закономерности развития эпидемического процесса в разных странах. Источником информации является русскоязычный сайт https://coronavir.ru/category/hronika-sobytij/, в котором на ежедневной основе, начиная с 19 февраля 2020 года, публикуется статистика по заболевшим, умершим, выздоровевшим в разбивке по странам.

Преследуемая цель настоящим исследованием – получение, на основе обработки статистических данных, трендовых зависимостей для прогнозирования числа заболевших в разных странах. Практическое применение – скорее учебно-просветительская, для получения более-менее достоверных аргументов для спора между сторонниками идей - «мы все умрём» или «это всё фигня для обрушения рынков». Попутно можно будет выявить страны, где активно фильтруют информацию о количестве заражённых и/или просто забили болт на профилактику и диагностику данного заболевания.

Методология исследования.

Всё достаточно просто.

  1. Ежедневные данные о количестве заражённых собираем в таблицы. Страны группируем по волнам заражения. Первая волна – это, собственно, Китай. Поскольку эпидемия в нём началась достаточно давно, то я, из-за ограниченности времени, не стал его вводить в исследование. Как развивался процесс в Китае можно посмотреть на сайте https://docs.google.com/spreadsheets/d/1f3LGuqwzegr7ZdGlzPOCDAyFk8RTaLTmMLF_K_5EVCc/htmlview?sle=true,  Вторая волна – это 4-е страны (Италия, Южная Корея, Иран, Япония), в которых количество заражённых начало активно расти с 19 февраля 2020 года. Таких стран, скорее всего, больше – в тех же Филиппинах китайцев более чем по много, однако, и заражённые там есть 100% - но официальная статистика в этих странах пока их не замечает. Это может быть следствием вообще слабой системы эпидемиологического контроля в этих странах. Не суть. Скоро всё узнаем. Третья волна – это, т.н. «растущие звёзды» - Бахрейн, Кувейт, Германия, Франция, Испания. Опять-таки, выделение только этих стран – следствие наличия в них развитой системы медицинской помощи населения, которая их диагностирует. Очевидно, что таковых стран больше.
  2. Данные по количеству заражённых представляются в графическом виде. Графики динамики заражённых в абсолютных значениях не очень удобны для изучения, т.к. из-за эффекта масштаба меньшие значения сливаются и превращаются, зрительно, в прямую линию (см. рис. 1). Для борьбы с этим явлением используется старый проверенный способ представления данных в логарифмической шкале (y=ln(x), где х – число заражённых на конкретную дату, ln – натуральный логарифм). 
  3. Аналогичные действия были проведены с показателями заражения стран третьей волны, результаты динамики в абсолютных цифрах представлены на рис. 2 
  4. Сопоставление динамики стран 2-й и 3-й волн (в логарифмическом масштабе) представлено на рис. 3
  5. Динамику роста количества заражённых в Китае я оцифрую на следующей неделе.
  6. Примечание. Динамику смертей я делать пока не стал. Потом, как ни будь.

Выводы.

Полученные данные о динамике роста заражённых в странах 2-й и 3-й волн позволяют сделать следующие выводы

  1. Логарифмическая шкала позволяет сопоставить динамику роста количества заражённых для стран, количество заражённых в которых различается в сотни раз.
  2. Динамика роста заражённых для большинства стран в анализируемой выборке имеет общий характер и примерно равные темпы роста
  3. Особо выделяется на фоне представленной выборки динамика роста заражённых в Японии. Страна имеет сопоставимую с Южной Кореей плотность населения, высокую суточную миграцию и т.д. Однако динамика крайне низкая и кардинально отличается от динамики других стран, что может быть обусловлено следующими причинами:
  • Крайне эффективная система выявления и изолирования носителей короновируса. На мой взгляд, учитывая ситуацию с туристическим лайнером и информации СМИ – это крайне маловероятное событие.
  • Крайне неэффективная система выявления и изолирования носителей короновируса. На мой взгляд, учитывая крайнюю тупизну властей в нестандартных ситуациях (а это – не стандартная ситуация) это вполне вероятно.
  • Действия властей по сокрытию достоверной информации о количестве заражённых. На мой взгляд, учитывая уже озвученные угрозы по отмене летних ОИ, это версия выглядит наиболее правдоподобно.

4. Германия и Франция, вели себя достаточно похоже с Японией. Возможно, что просто не диагностировали новых заболевших (не искали, не там искали, не очень то и хотелось). Но, видимо количество жалоб/заражённых стало так велико, что они сломались и встали в общую струю.

После обработки данных по Китаю, можно будет, теоретически, делать более-менее долгосрочные прогнозы.

Рис.1 

Рис. 2

Рис. 3

 

 

 

 

 

Авторство: 
Авторская работа / переводика
Комментарий автора: 

Материал к обсуждению. Пока статистика не очень обширная, поэтому какие-либо прогнозы делать надо осторожно. К концу следующей недели всё станет более ясно.

Комментарии

Аватар пользователя Каджи
Каджи(7 лет 4 месяца)

Да да конечно, раз ВОЗ сказало то есть у всех

ну и наличие и их применение это тоже две большие разницы.

Но у нас , например, тест делают  при обращении к врачу с просьбой сделать такой тест  и при наличии показаний (если конечно Роспотребнадзор не обманывает) https://tass.ru/obschestvo/7853509?utm_source=yxnews&utm_medium=desktop&utm_referrer=https:%2F%2Fyandex.ru%2Fnews

Ну правда сейчас уже в принудительном порядке (наверное) будут делать тесты   тем у кого пневмония (26.02.2020) https://ria.ru/20200226/1565240063.html

 

Мое мнение, у нас не хотят срывать голосование по Конституции, поэтому до 22 апреля никакой эпидемии  у нас не будет, а будет просто рост ОРВИ "сезонное повышение заболеваемости"

https://ria.ru/20200227/1565275002.html

Аватар пользователя Alignment
Alignment(4 года 9 месяцев)

Хорошо подмечено. Поживём подольше, увидим побольше…

Аватар пользователя Каджи
Каджи(7 лет 4 месяца)

дел

Скрытый комментарий Повелитель Ботов (без обсуждения)
Аватар пользователя Повелитель Ботов

Перспективный чат детектед! Сим повелеваю - внести запись в реестр самых обсуждаемых за последние 4 часа.

Комментарий администрации:  
*** Это легальный, годный бот ***
Аватар пользователя tuk
tuk(8 лет 11 месяцев)

Про Сингапур не написано. ИМХО Сингапур гасит эпидемию просто идеально. Отслеживает все контакты при участии полиции, все близкие контакты в карантин, жесткие санкции за нарушение карантина и т.д.

Пресс-релизы

Еще четыре случая выписаны, подтверждены три новых случая инфекции COVID-19

 

 

Аватар пользователя Нижегородец
Нижегородец(10 лет 6 месяцев)

Это обусловлено сильно ограниченной территорией - фактичеки весь Сингапур - подкарантинная территория. Плюсом идёт авторитарный (как это сейчас принято назвать) стиль руководства данной территорией.

На других территориях такой фокус не пройдёт.

Комментарий администрации:  
*** отключен (кишки военных пусть обсуждает в других местах) ***
Аватар пользователя tuk
tuk(8 лет 11 месяцев)

Гонконг - примерно такая-же ситуация, то же тотальный контроль. Южная Корея - они конечно здорово запустили, но сейчас проводят операцию по отслеживанию и масштабному тестированию сотен тысяч человек. ИМХО у Южной Кореи есть шанс остановить эпидемию. Проблема Южной Кореи такая-же как и у Ирана. Они не закрыли Китай. Иран закрыл только вчера, а Китай сам закрылся от Кореи вчера. ИМХО тут уже виновата ВОЗ, которая рекомендовала всем странам не закрывать авиасообщение с Китаем. Вот те кто не закрыл, те и пострадали. У Италии думаю что шансов нет, так как они уже ввели ограничения на тестирование, ну и вообще там бардак, так же как и в Японии.  Но в Европе тоже полно стран которые могут организовать массовое тестирование и изолирование больных, и карантин для близких контактов. Этого должно хватать для того чтоб снизить reproduction number ниже единицы, и предотвратить эпидемию.

Аватар пользователя Нижегородец
Нижегородец(10 лет 6 месяцев)

Чем более "развитее демократия в стране" - тем меньше шансов у неё на благополучный исход. Так что вероятность одной из стран Европы закуклиться для борьбы с эпидемией мизерны. Торговля. шенген и прочие связи оборвать не получиться. Ибо просто кушать будет местами нечего.

Посмотрим, как оно получиться.

Комментарий администрации:  
*** отключен (кишки военных пусть обсуждает в других местах) ***
Аватар пользователя Herz
Herz(11 лет 5 месяцев)

Но в Европе тоже полно стран которые могут организовать массовое тестирование и изолирование больных, и карантин для близких контактов. Этого должно хватать для того чтоб снизить reproduction number ниже единицы, и предотвратить эпидемию

И как долго эти страны смогут находиться в изолированном режиме? Полгода, год? Да, ладно, ни одна страна не протянет и нескольких месяцев. Инфекция будет гулять по планете не меньше года и чем больше носителей сейчас, тем ярче будут вторичные вспышки. Кстати, Китай тоже вряд ли их избежит

Комментарий администрации:  
*** Отключен (знакомьтесь - зеленый пиарщик, коронавирусный хайпожор и систематический дезинформатор) ***
Аватар пользователя tuk
tuk(8 лет 11 месяцев)

Не нужен изолированный режим. Чтоб остановить эпидемию нужно понизить reproduction number ниже единицы. Допустим он равен четырем. Если отслеживанием близких контактов уже диагностированных мы убираем в карантин половину заразившихся - то reproduction number понижается в два раза. Если в среднем каждый заболевший заражает половину до второго дня болезни (а вторую половину после), а мы в среднем на второй день после появления симптомов каждого заболевшего диагностируем и изолируем - то понижаем  reproduction number еще в два раза. Итого понизили в четыре раза, и эпидемии нет. Есть разовые случаи и разовые кластеры, не более того.

Изолироваться полностью не обязательно. Нужно изолироваться только от очагов. А остальных проверять (температуру) при прилете. Если вдруг окажется носителем - то см. предыдущий абзац. Вовремя диагностируем, и отслеживаем контакты. Там где уже возникла эпидемия - вводится карантин, ровно так-же как и при гриппе.

И есть шанс что всё будет не так плохо, как некоторые прогнозируют - есть прогнозы по которым количество умерших будет от 10 до 100 миллионов, практически полный прирост населения земли за год. Если вдруг сбудется настолько негативный прогноз, год можно будет назвать "годом, когда население земли не увеличилось".

Но есть маленькая проблема - некоторые исследователи утверждают что болезнь еще заразней чем думали до сих пор, и R0 больше шести...

 

Аватар пользователя Herz
Herz(11 лет 5 месяцев)

Изолироваться полностью не обязательно. Нужно изолироваться только от очагов. А остальных проверять (температуру) при прилете. Если вдруг окажется носителем - то см. предыдущий абзац. Вовремя диагностируем, и отслеживаем контакты. Там где уже возникла эпидемия - вводится карантин, ровно так-же как и при гриппе

Весь этот идеализированный алгоритм работает только в одном случае, в стране живут биороботы (китайцы), которые абсолютно четко соблюдают дисциплину. В обычных странах чихающий, кашляющий персонал переносит грипп на ногах. Если нет температуры под 40 это скорее норма. Так как завоз становится возможным откуда угодно, границы нужно или закрывать полностью или вовсе забить на эту процедуру, фиксить пирометрами температуру и всё.

С вероятностью близкой к 100% шнягой переболеют за несколько лет практически все. Все потуги нужны лишь с одной целью, дотянуть до момента когда появятся лекарства снижающие смертность до фонового уровня (обычный грипп)

Комментарий администрации:  
*** Отключен (знакомьтесь - зеленый пиарщик, коронавирусный хайпожор и систематический дезинформатор) ***
Аватар пользователя tuk
tuk(8 лет 11 месяцев)

Против гриппа до сих пор есть только симптоматические, всякие "релензы" практически бесполезны (снижает осложнения на 20% по сравнению с плацебо). Почему вдруг должно появится эффективное лекарство против коронавируса? Скорей всего ждать нужно вакцину. Но её скоро не обещают, и тем более скоро не обещают промышленный выпуск в масштабах всего населения земли.

Аватар пользователя Herz
Herz(11 лет 5 месяцев)

Скорей всего ждать нужно вакцину. Но её скоро не обещают, и тем более скоро не обещают промышленный выпуск в масштабах всего населения земли.

С соблюдением всех процедур вакцина появится не раньше, чем через год. Вирусы обладают высокой мутабельностью, к тому времени в ходу будет уже не один штамм вируса. Грипп вакцинацией не удается завалить даже в развитых странах, одна эпидемия гриппа в США в текущем году чего стоит. Нет, я бы не стал делать большую ставку на вакцину.

Комментарий администрации:  
*** Отключен (знакомьтесь - зеленый пиарщик, коронавирусный хайпожор и систематический дезинформатор) ***
Аватар пользователя tuk
tuk(8 лет 11 месяцев)

Грипп не удается, а вот краснуху, корь, паротит и т.д. - очень даже удалось.

Аватар пользователя Simurg
Simurg(7 лет 2 месяца)

Ну, скажем, к кошачьему коронавирусу вакцина есть. И она много лет, как работает. Значит, у по меньшей мере у того вируса есть какие-то неменающиеся или слабо меняющиеся белки, на которых работают одни и те же антитела.

Вариант "а ля грипп" есть, но пока не факт, что у нас нечто вроде такого. А если нет такого, то поголовной вакцинацией (как с оспой) можно уничтожить вирус как класс (за исключением природных резервуаров, типа тех же мышек).

Комментарий администрации:  
*** Уличен в клевете и ложном цитировании, отказ принести извинения - https://aftershock.news/?q=comment/11527284#comment-11527284 ***
Аватар пользователя Виток
Виток(5 лет 6 месяцев)

А всё-же фантастика бывает не только читабельной, но и предсказабельной. Захар Оскотский. Гуманная пуля.

Не сказать, чтобы один в один.. Но совпадений очень много. 

https://e-libra.ru/read/348266-gumannaya-pulya.html

Аватар пользователя e-Jinn
e-Jinn(4 года 5 месяцев)

Тяжёлый случай у автора. Чем он Вас заинтересовал, что вы ЭТО предлагаете? 

Аватар пользователя Виток
Виток(5 лет 6 месяцев)

Не знаю, как вы столь быстро определили "тяжелость" случая.. Я читал его лет 8 назад. Зашло неплохо, а сейчас просто вижу определённые совпадения. 

Аватар пользователя Читающий
Читающий(5 лет 4 месяца)

Ванга 2 ?

Аватар пользователя Виток
Виток(5 лет 6 месяцев)

В фантастике довольно часто авторы описывают события (открытия, катастрофы, социальные модели), которые затем опционально совпадают с реальными. Этот факт известен, видимо, не только лишь всем...

Аватар пользователя Читающий
Читающий(5 лет 4 месяца)

Странный оборот. В принципе таких фантастов  много, которые предсказывают какие-то технические достижения. Что касается политических  событий, то это реже.

Аватар пользователя Виток
Виток(5 лет 6 месяцев)

Дк. Я примерно об этом и вещаю. Азимов, Бредбери, Оруэл,  Беляев, Лем, Стругацкие и многие другие сказали очень много, но не везде угадали. Но ведь где-то - угадали!

В этом и есть их роль - предположить, а что там будет дальше?..

Аватар пользователя Читающий
Читающий(5 лет 4 месяца)

К предсказаниям люди относятся с мистическим  оттенком.

Аватар пользователя Drache76
Drache76(6 лет 9 месяцев)

читаю про вирус, один вопрос у меня всего:

везде пишут, что больных лечат усиленными дозами антибиотиков.

хотя всем известно, что антибиотики предназначены для борьбы с бактериями, а на вирусы не оказывают никакого действия.

??? как это понимать?

Комментарий администрации:  
*** Современное яо относительно чистое (с) ***
Аватар пользователя Simurg
Simurg(7 лет 2 месяца)

Где это такое пишут? по каким помойкам Вы лазаете, что это даже "везде"?

Хотя антибиотики, ессно, применяются при осложнениях, как и для любой вирусной инфекции. (В тяжёлых случаях иммунитет ослаблен настолько, что активируется всякая внутренняя зараза типа стафилококков, и вот её-то и приходится давить антибиотиками, иначе сожрёт заживо).

Комментарий администрации:  
*** Уличен в клевете и ложном цитировании, отказ принести извинения - https://aftershock.news/?q=comment/11527284#comment-11527284 ***
Аватар пользователя Читающий
Читающий(5 лет 4 месяца)

Это в геманиях пишут?  Хоть одну ссылочку такую дадите?

Аватар пользователя Читающий
Читающий(5 лет 4 месяца)

В России имеется штамм коронавируса COVID-19 и на данный момент разработано пять прототипов вакцины от нового заболевания. Об этом сообщила глава оперативного штаба вице-премьер России Татьяна Голикова.

«Штамм у нас есть, мы его получили. Наработано "Вектором" пять прототипов вакцины, это начальная стадия работы», - сказала она, отметив, что штамм вируса был получен не от Китая.

https://www.ul.kp.ru/online/news/3778661/   

Конечно, до вакцины далеко, но хоть реальное начало положено!  Ранее я писал, что Китай так и не передал нам нативный коронавирус

 

 

Страницы