Вход на сайт

МЕДИАМЕТРИКА

Облако тегов

Первая расшифровка генома в России в Курчатовском институте в 2009г.

Аватар пользователя valerkav

Заинтересовавшись речью директора Курчатовского института из предыдущей статьи. Напомню, там сказано прямо с трибуны Совета Федерации России, что некая элита пытается поработить планету и вывести новую "породу" людей и угрозе избирательного по этносу генетического оружия. Решил посмотреть чем занимается данное заведение в области генетики. Нашел небольшую заметку от 25 января 2010 с новостью о первой расшифровке генома русского человека. В статье сотрудник института рассказывает об отличиях генома русского от других этносов, потерявшемся следе татар, влиянии алкоголя и скором создании паспорта граждан на основе генной информации.

В российском научном центре «Курчатовский институт» расшифровали геном русского

- Да, мы получили полный геном русского мужчины, - подтвердил достижение академик РАН Константин Скрябин, руководитель геномного направления в РНЦ «Курчатовский институт». - И теперь появилась возможность сравнить с ним составленные прежде генетические «портреты» африканца, китайца, корейца и европейца. К тому же Россия вошла в клуб стран, которые способны осуществлять столь масштабные проекты.

Читая генетическую информацию, российские исследователи использовали достижения нанотехнологий и мощный курчатовский суперкомпьютер. И расшифровали геном быстрее и дешевле, чем это прежде удавалось зарубежным коллегам.

О результатах рассказывает один из авторов исследования, ведущий научный сотрудник, заведующий лабораторией геномного анализа кандидат биологических наук Егор ПРОХОРЧУК.

ПОИСК «ОПЕЧАТОК»

- Егор Борисович, как искали «чисто» русского?

- Сначала были экспедиции совместно со специалистами по этнографии из институтов в Уфе, Томске, Новосибирске. Потом составили коллекции различных этносов: русских, татар, башкир, якутов, бурят, украинцев, мегрелов, осетин, абхазов, карелов. Всего около 1,5 тысячи человек 40 этносов Российской Федерации. Проанализировали их гены. Но не полностью геном, а только «опечатки» в нем. Это и позволило нам найти отличия между этносами. Сейчас, если бы мне принесли две пробирки с кровью, принадлежащей людям разных национальностей, и попросили угадать, кто есть кто, я бы их легко вычислил.

Кстати, в России живут больше 100 национальностей. Но русских большинство - их около 70 миллионов. Второй по численности этнос - это татары, потом - украинцы. Скорее всего, следующий геном, который мы возьмемся расшифровывать, будет геном татарина.

- Так кто такой русский? Тот, кто говорит по-русски? У кого мама и папа русские?

- Это не важно. Главное, чтобы он вписывался в составленную нами математическую модель генома русского человека. Она очень сложная и понятна лишь специалистам.

- Но в итоге вы вышли на конкретного русского, соответствующего всем параметрам вашей модели?

- Да, им оказался один человек из онкоцентра, который страдал раком почки. И его геном полностью расшифровали.

- Почему взяли больного?

- Пациенты больниц находятся под постоянным контролем врачей, и у них легко брать анализы.

СЛЕД ТАТАР СТЕРСЯ

- Есть расхожее выражение, что татарское семя полило русскую землю. Много в нас этого семени?

- Практически нет. Мы очень мало находим татарских корней в современных русских. Русские существенно ближе к европейцам. Много общего у нас с поляками, восточными немцами, прибалтами - вообще со всеми славянскими народами, живущими в Восточной Европе. И мы далеки от татар, башкир, хантов, якутов, бурят.

- Русские чем-нибудь особенным отличаются от всех остальных?

- Полный список отличий мы пока привести не можем. Например, для того чтобы понять, чем отличаются русские от китайцев, надо расшифровать геномы как минимум 10 русских и 10 китайцев. И найти что-то общее среди них. У нас же пока есть расшифрованные геномы одного китайца и одного русского. Вообще задача стоит: расшифровать по 1000 геномов каждой нации.

МНОГО ПЬЮТ

Пока же выяснилось, к примеру, что у русских в отличие от азиатов ген алкоголя дегидрогеназа более активно вырабатывает фермент, отвечающий за разложение спирта. И потому русским, чтобы захмелеть, требуется гораздо больше выпивки. Тогда как иным азиатам достаточно и рюмки.

Другое отличие связано с геном лактозы, который отвечает за переваривание молока. Этот ген есть у всех северных людей и отсутствует у южных народностей. Его наличие связано с развитием молочного земледелия по мере продвижения людей на север, когда человечество расселялось по Земле. Сейчас итальянцы, евреи не переваривают молоко, потому что исторически они никогда его не пили. А у скандинавов, голландцев, русских молоко - один из основных продуктов питания.

Еще один интересный факт. Оказалось, что у русских поморов, живущих на Белом море, есть некие отличия, которые делают эту популяцию очень устойчивой к ВИЧ. И вообще у всех северных народов, в том числе у русских, скандинавов, особенно у исландцев, жителей Северной Норвегии, очень велик процент таких полезных мутаций, которые делают этих людей устойчивыми к заражению ВИЧ. Поэтому в северных странах, в том числе в России, темпы развития СПИДа оказались намного ниже, чем прогнозировали многие медики. А у южных народов такой сильной защитной функции на генном уровне нет.

КОГО СЪЕДАЕТ РАК

- Можно выяснить, какие болезни какой нации присущи?

- Это дело будущего. Но, например, есть болезнь ашкенази, присущая замкнутой группе евреев. И чтобы не рождались больные дети, многие евреи, например в нью-йоркской общине, перед вступлением в брак сдают генетический тест на совместимость. Но у русских таких проблем точно будет меньше, потому что мы активно брали другие гены и не накопили вредных мутаций.

- Рак съедает всех?

- Для России это не самая главная болезнь. Первая причина смертности у нас - сердечно-сосудистые заболевания, потом - травматизм, рак - на третьей позиции. Вообще все сложные заболевания, в том числе и онкология, не кодируются каким-то одним геном. На их развитие влияет целый комплекс факторов: экология, питание, стрессы, образ жизни. Генетика является лишь одним фактором, может, важным, но не всегда стопроцентно предсказательным.

- Признанный в мире физиолог профессор Оксфорда

Дэннис Нобл в своей нашумевшей книге «Музыка жизни. Биология за пределами генов» утверждает: геном не является «программой жизни» и ничего не определяет в жизни человека. Вы согласны?

- Нет, это выражение крайней позиции. А есть ученые, которые убеждены, что от генома, напротив, зависит все и ничего - от внешних факторов. Мы считаем, что надо придерживаться золотой середины. Например, в Америке генетическое тестирование женщин на рак груди приносит очень хорошие результаты. Когда они узнают, что предрасположены к этой болезни, то делают маммограмму два раза в год. И, на удивление, смертность в этой группе существенно ниже, чем у тех, кто к генетикам не обращался.

ВТОРОЙ ПАСПОРТ

- Появится у каждого человека генетический паспорт, где будут описаны все его особенности и предрасположенности?

- Конечно, весь мир идет к так называемой персональной медицине. В США есть компания «23 и я» - 23 хромосомы и я, куда можно отослать образец своей слюны и в течение 1,5 месяца через Интернет получить информацию о своей предрасположенности к каким-то из 150 заболеваний. Стоит это 600 - 700 долларов. В России тоже нечто подобное появится уже в будущем году. Но мир идет к тому, что следующим этапом будет прочтение всего генома. И в России генетические паспорта могут появиться уже через 5 - 10 лет.

- Сколько стоит расшифровать геном одного человека?

- Сейчас 150 000 долларов. Но в будущем цена не будет превышать 1000 долларов. Кстати, в 2001 году расшифровка первого генома обошлась в 3 млрд. долларов.

- Как генпаспорт поможет врачу?

- По карточке с вашим геномом врач может увидеть слабые точки. И для диагностики уже не придется бегать по ста кабинетам. Будете целенаправленно следить за теми болезнями, к которым вы склонны. И принимать только те препараты, которые будут усваиваться именно вашим организмом.

- Разве есть лекарства, которые не все гены «переваривают»?

- Оказалось, что есть. Не так давно выяснилось, что одно лекарство от сердечно-сосудистых заболеваний действовало хорошо на африканцев, а на белых не влияло никак. Причина скрывалась в одном компоненте медикамента, действующего на белок, который отличался у черных и белых.

- Но тогда можно будет изготовить средство, которое станет не лечить, а уничтожать одну или другую нацию? И таким образом создать генетическое оружие?

- Можно вполне.

- Зная весь геном человека, возможна будет дискриминация, например, при поступлении на работу?

- До 2013 года в мире существует мораторий на использование генетических данных при приеме на работу или выписке страховки на вашу жизнь. Ведь если страховая компания будет знать о предрасположенности к смертельному заболеванию, то ей будет невыгодно страховать вас на маленькую сумму, чтобы самой не оказаться в пролете.

- Но 2013 год уже не за горами. Что будет потом?

- Неизвестно. Это больше гуманитарная проблема, чем научная.

- Но дискриминация неизбежна? А вслед за ней - и расслоение общества?

- Конечно, все к этому идет. Для этого мы и должны быть во всеоружии, чтобы не оказаться на обочине истории. Поэтому и созданы в Курчатовском институте соответствующий центр и наша лаборатория, которая в нужный момент сможет ответить на новый вызов времени. Как когда-то, в 1940 - 1950-х годах, наш институт ответил на вызов, связанный с созданием ядерной бомбы, первого русского реактора. Когда сам факт существования России как независимого государства был связан с историей создания Курчатовского института.

Источник: http://www.samara.kp.ru/daily/24429.5/598146/, автор статьи: Светлана Кузина.

 


♦ Чтобы 2 раза не вставать, и видно было динамику развития, добавлю здесь другое интервью этого же специалиста (спустя 3 года) 05 января 2013:

«Мы прошли большой путь для определения генотипа плода по его ДНК в крови матери»

...

Насколько ваши исследования могут сейчас влиять на жизнь "обыкновенного" человека? 

Расскажу на своем примере. У меня двое детей. Некоторое время назад мы с женой узнали, что у нас будет третий ребенок. Моей жене Анне 37 лет, она автоматически попадает в группу риска. После одного из тестов (наверное, на втором месяце беременности) ей  позвонили и сказали: знаете, голубушка, у вас точно будет ребенок с синдромом Дауна, - вообще, без шансов. 

Если сейчас женщина попадает в подобную ситуацию, то ей делают амниоцентез - берут часть плода. Это инвазивная процедура с риском осложнений и заражения с вероятностью один к десяти. Немногие женщины соглашаются на это. 

Однако, к настоящему моменту мы прошли большой путь для определения генотипа плода по крови матери. Оказалось, что в крови матери, даже на сроке в шесть недель, циркулирует определенное количество ДНК плода. Если научиться читать эту информацию, взяв кровь матери, то таким простым и безопасным тестом можно заменить  всю историю, связанную с инвазивной диагностикой. Это должно быть безопасно, надежно и по стоимости сравнимо с тем, что государство тратит на инвазивные процедуры. Так, клинике вся процедура инвазивного тестирования обходится приблизительно в 14 тысяч рублей. Но за эти деньги можно проводить секвенирование свободноциркулирующей ДНК и достаточно надежно прогнозировать заболевания - с вероятностью 99,7%. Благодаря моим возможностям я секвенированил ДНК плода своего ребенка, которому поставили страшный диагноз, - и информация о синдроме Дауна не подтвердилась!

В крови матери, даже на сроке в шесть недель, циркулирует определенное количество ДНК плода. Если научиться читать эту информацию, взяв кровь матери, то можно заменить  всю историю, связанную с инвазивной диагностикой.

Насколько перспективны эти технологии?

Мне кажется, что это очень перспективная история, которую можно внедрить в клиники, обезопасить женщин. Другое дело, что это встретит массу протестов со стороны тех людей, для которых это бизнес: не нужна палата, не нужно госпитализировать, не нужна операция, требуется просто взять кровь. Мы пытаемся найти тех людей, которым это интересно, и которые понимают, что за этим будущее.

Сейчас у нас есть технология, а дальше нужно, чтобы все заработало. Для этого нужна логистика, инфраструктура, нужны десятки секвенаторов, специалисты очень высокого уровня, нужны серверы, биоинформатики, кластеры. И это должно быть оперативно по времени, потому что нужно информировать и принимать решение в течение недели. 

Похоже, это может стать  первым массовым применением технологий секвенирования, когда они действительно востребованы, а не просто дают избыточное количество информации. Когда вы как мышка в гигантском швейцарском сыре ползаете по его дырочкам, количество информации огромно, а что из неё следует – непонятно. 

Нужна логистика, инфраструктура, нужны десятки секвенаторов, специалисты очень высокого уровня, нужны серверы, биоинформатики, кластеры. (прим. 3года спустя(12 февраля 2016) данная услуга уже доступна и стоит 33000руб.)

Вот ваш геном: 3 млрд букв на дискете; это будет стоить, допустим, 20 тысяч евро. Но когда вы придете с этой информацией к врачу и спросите у него, что у меня с организмом,- вас ждет конфуз, поскольку эта информация пока неперевариваемая; практически невозможно найти врача, который по информации о вашем геноме выдаст рекомендации по лечению и профилактике.

Над чем работают секвенаторы Курчатовского института ?

В Курчатовском институте мы уже отсеквенировали десятки раковых геномов, участвуем в консорциуме по секвенированию рака почки. Условно говоря, врачи дают нам раковую и нераковую ткань, а мы ищем генетические отличия. Данный проект реализуется в рамках международного консорциума, в который входят англичане, французы, шведы, чехи и русские. Это финасируется в рамках европейской седьмой рамочной программы. 

Это технология, за счет которой в Курчатовском институте мы поддерживаем наши возможности по секвенированию. Результат – практический выход: как можно классифицировать опухоль по генотипу, а, уже зная её генотип, можно подобрать правильное лекарство. Цель эксперимента – классифицировать опухоль и понять, какой в  этой опухоли нарушен путь на молекулярном уровне (поэтому лекарство, направленное на другой путь, бессмысленно). Здесь задача - персонифицировать онкологию в зависимости от типа опухоли. В частности, для HER2-положительных опухолей рака груди и HER2-отрицательных будут совершенно разные лекарства. 

В Курчатовском институте мы уже отсеквенировали десятки раковых геномов, участвуем в консорциуме по секвенированию рака почки. Условно говоря, врачи дают нам раковую и нераковую ткань, а мы ищем генетические отличия.

Классификаций рака груди, по итогам последней конференции, уже шесть. Для каждого отдельного вида рака будет свое лекарство, каждый - индивидуален и конкретно под него можно будет подбирать терапию. В таких разработках мы активно участвуем. 

От применения таких технологий в медицине ждут очень многого. Мы занимались и болезнью Альцгеймера. Отсеквенировали геном семьи из Орловской области, у которых на протяжении трех поколений наблюдались признаки болезни Альцгеймера.  

Эта работа продолжается, мы очень надеемся, что сможем дополнить список существующих генетических маркеров этой болезни. Еще одно направление - популяционная генетика. Можно выяснить, что происходит в России с миграцией, отследить исторические закономерности. Такие темы более философские и связаны уже с конвергенцией наук, с формированием обозначенных в нашем институте “био-когно”-направлений.

«Генетическое пространство» Евразии. Каждая точка - геном одного человека. Анализ генома был проведен по 300 000 однонуклеотидных полиморфизмов с помощью микроматриц ДНК. Таким образом все образцы можно было разместить в пространстве размерности 300 000. Методом «основных компонент» (Principal Component Analysis) это пространство «свернуто» до двухмерного так, чтобы минимальным образом деформировать генетические расстояния между индиви-дуальными образцами. Принадлежность образца этнической группе показана разными цветами. Образцы группируются таким образом, что генетические расстояния напоминают географические расстояния между соответствующими этносами

 

Еще занимаемся характеристикой осетров Каспийского моря: в Иране утверждают, что вылавливают эндемический вид (представители которого обитают на относительно ограниченном ареале – Полит.ру) и что эндемики не подвергаются мораторию на вылов.  А мы, - что иранцы вылавливают наших – осетр у нас нерестится, кормится и идет к их побережью. Мы хотели разобраться, так ли это. 

Мы отсеквенировали матричную РНК нескольких русских и иранских осетров, нашли полиморфные однонуклеотидные вариации. Их использовали в качестве маркеров для классификации около сотни рыб, выловленных в разных акваториях Каспийского моря. В результате мы пришли к определенным выводам и смогли классифицировать осетров.

Чувствую, что в Курчатовском институте мы будем постепенно перемещаться к работам с древними ДНК, т.е. смещаться в сторону антропологии и палеонтологии. Мне интересны и вопросы молекулярной проблемы памяти, - то чем занимается К.В. Анохин (руководитель отдела нейронаук НИЦ «Курчатовский институт»). Правда, если  у него - физиология,то мне было бы интересно понять, что происходит с эпигенетическими маркерами. Есть идея, что маркеры – это механизм закрепления памяти, что в ДНК нет изменений, но что-то происходит с экспрессией генов. 

Для происхождения лошадей, их одомашнивания есть интересные модели. Мы сейчас частично секвенируем лошадь из Якутии, которая очень долго жила при холоде. В результате мы можем понять, какие гены у лошадей могли отвечать за адаптацию к низким температурам и сравнить с геномами других лошадей, той же лошадью Пржевальского, которая не подвергалась таким низким температурам.

Источник


И вот уже практические реализации англичан за прошлый год (25 янв 2015):

Британские ученые предложили неординарный способ борьбы с геморрагическими лихорадками (лихорадки денге и чикунгунья). В биотехнологической лаборатории, организованной учеными из Оксфорда, были созданы генетически модифицированные комары Aedes aegypti, являющимися переносчиками инфекции. В ДНК модифицированных особей были включены последовательности генома вируса герпеса, бактерии E.coli , кораллов и крестоцветных растений. В результате таких изменений генома взрослые особи Aedes aegypti остаются жизнеспособными, тогда как личинки комаров погибают до того как начинают летать и питаться. Отобранные генетически модифицированные комары были выпущены на Каймановых островах в качестве эксперимента, при этом естественная популяция Aedes aegypti сократилась на 96% за 6 месяцев. В дальнейшем ученые планируют выпустить генетически модифицированных комаров на территории США (на изолированном острове Ракун Ки). Однако, местные жители относятся скептически к проведению эксперимента, опасаясь вреда от укусов генетически модифицированных комаров.

Источник

Фонд поддержки авторов AfterShock

Комментарии

Аватар пользователя Производственник

Сдается мне, что будь возможность создать расовое оружие, кто то упоротый давно бы это сделал. Получается, что или это невозможно, или кому то не нужен такой легкий путь к господству. Или бог не дает.

Аватар пользователя геополитик однако

Из материала же видно что только в начале пути, к самой  возможности создания как вы сказали расового оружия
 

Аватар пользователя domovoy
domovoy(2 года 10 месяцев)(01:04:39 / 13-02-2016)

КМК, было бы самонадеянным считать, что имеешь информацию обо всех видах оружия. Я о подобных вещах слышал еще в двухтысячных. И вроде как оружие уже имело место быть. Только вы же понимаете, кто ж вам скажет, точно подтвердит... Наоборот, голову открутят и скажут, что так и былО ;)

Аватар пользователя Cat-Advocate
Cat-Advocate(3 года 10 месяцев)(21:50:29 / 12-02-2016)

"новость" с бородой до колен, за январь 2012 годаno

Аватар пользователя геополитик однако

спасибо,познавательно
 

Аватар пользователя p1ayb0y
p1ayb0y(1 год 9 месяцев)(00:20:42 / 13-02-2016)

У обамы спецслужбы стирают после мероприятий все биологические следы, чтобы никто не мог проанализировать геном и сделать точечную био атаку. А у вас есть такая спецслужба?

Аватар пользователя nnon.
nnon.(2 года 9 месяцев)(04:11:10 / 13-02-2016)

 

амниоцентез - берут часть плода

безграмотная статья

Аватар пользователя Имперский шут

Естественно что у русских нет генома татар. Татары приходили в первую очередь за рабами. Потому у нас так много городов и деревень обезлюдело. Убивали всех кто сопротивлялся, остальных на рынки рабами. кто может родить, тот может и работать.  Так что это у татар русской крови полно будет.

Лидеры обсуждений

за 4 часаза суткиза неделю

Лидеры просмотров

за неделюза месяцза год

СМИ

Загрузка...