Опубликовано исследование международной коллаборации COVID-19 Host Genetics Initiative (COVID-19 HGI): три метаанализа геномных ассоциаций с COVID-19, в которые вошли почти 50 тысяч пациентов. В этой работе описаны 13 локусов, ассоциированных либо с чувствительностью к инфицированию коронавирусом SARS-CoV-2, либо с тяжестью течения COVID-19. Часть из них пересекается с локусами, имеющими отношение к легочным, аутоиммунным и воспалительным заболеваниям. Некоторые генетические варианты, связанные с COVID-19, имеют этногеографическую специфику.
На тяжесть COVID-19, как показывают наблюдения, неблагоприятно влияют мужской пол, возраст и индекс массы тела. Но эти три фактора не объясняют всех различий в течении болезни у разных людей. Очевидно, генетические факторы тоже играют роль. Исследования выявили несколько геномных локусов, которые коррелируют с течением COVID-19, наиболее сильная корреляция обнаруживается в локусе 3p21.31. Но такие работы находятся лишь в начале пути, и в генетических факторах COVID-19 пока очень много неясного. Чтобы развивать и координировать такие исследования, специалисты создали международную коллаборацию COVID-19 Host Genetics Initiative (COVID-19 HGI).
В журнале Nature опубликовано проведенное COVID-19 HGI масштабное исследование. Это результаты трех метаанализов, в которые вошли 46 исследований геномных ассоциаций (GWAS), охватившие в общей сложности почти 50 тысяч пациентов с COVID-19 из 19 стран. Страны представляют разные регионы: Европу, Америку, Африку, Ближний Восток, Южную Азию и Восточную Азию.
Вошедшие в исследование пациенты различались по степени тяжести COVID-19. Ученые выявляли геномные ассоциации с тремя показателями: 1) с критически тяжелым течением COVID-19, при которым пациенты нуждаются в ИВЛ или умирают; 2) со средним/тяжелым течением, при котором пациентов госпитализируют; 3) с фактом подтвержденной инфекции SARS-CoV-2 вне зависимости от симптомов. Популяционным контролем для всех этих категорий служили группы того же этнического происхождения без коронавирусной инфекции. Средний возраст участников составил 55 лет.
В ходе трех метаанализов авторы выявили независимые геномные ассоциации с COVID-19 в 13 локусах. Два из них расположены вблизи ранее известного локуса 3p21.31. Большинство из них имеют два аллеля, один из которых коррелирует с показателями коронавирусной инфекции.
Из 13 локусов шесть проявили ассоциацию с критически тяжелым COVID-19, девять локусов — с течением COVID-19 от среднего до тяжелого с госпитализацией, наконец, семь локусов показали ассоциацию с инфицированием SARS-CoV-2 без учета симптомов. То есть, некоторые локусы были связаны с чувствительностью к заражению коронавирусом SARS-CoV-2, а другие проявили связь с тяжестью течения COVID-19 и с исходом болезни.
В ходе анализа найденных локусов исследователи установили, что многие из них перекрываются с локусами, имеющими отношение к болезням легких. Так, вариант rs2109069:G>A в гене DPP9 (локус 19p13.3), ассоциированный с критически тяжелой болезнью, ранее был описан как повышающий риск интерстициальной болезни легких. Другой вариант rs1886814:A>C в гене FOXP4 связан с развитием легочной аденокарциномы. Ген CXCR6 играет роль в хемокиновых сигнальных путях. Некоторые варианты, ассоциированные с COVID-19, изменяют экспрессию многих других генов в легких. Так, аллель Rs2271616:G>T, ассоциированный с чувствительностью к SARS-CoV-2, влияет на несколько участков гена SLC6A20, который связан с рецептором ACE2. Еще несколько локусов перекрываются с регионами, имеющими связь с аутоиммунными и воспалительными заболеваниями. Однако не для всех локусов удалось найти кандидатные гены, которые могли бы быть вовлечены в механизм их ассоциации с COVID-19.
Авторы не выявили какой-либо связи генетических вариантов в описанных 13 локусах с полом. Но зато обнаружили их связь с этногеографическим происхождением. Так, два локуса с аллелями rs1886814 и rs72711165 показали корреляцию с тяжелым течением COVID-19 лишь в четырех исследованиях на пациентах восточноазиатского происхождения. Один из них, расположенный близко к гену FOXP4, с достаточной частотой встречается в Восточной Азии (32%) и среди американцев смешанного происхождения (20%), на Ближнем Востоке его частота 7%, а в Европе – всего 2-3%. Указанный ген экспрессируется в эпителии дыхательных путей и играет важную роль в легочных функциях.
Коллаборация COVID-19 HGI продолжит изучать этноспецифические генетические варианты, имеющие отношение к COVID-19, в разных популяциях. Все новые данные публикуются на сайте www.covid19hg.org .
Вместе с тем авторы статьи подчеркивают, что нужны дополнительные исследования, чтобы понять биологическую роль обнаруженных генетических вариантов и их клиническую значимость.
текст Надежды Маркиной
Источник:
COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19 // Nature https:// doi.org/10.1038/s41586-021-03767-x (2021).
Комментарии
Перевел бы ты на человеческий эту писанину
Тоже ни рожна не понял. Кроме того, что хреновее всего от ковидлы толстым старым мужикам. Я хоть и старый, но не толстый. Значит - мона.
Перевел. Смотри авторский комментарий.
А, это... Ни фига не новость.
Русский народ (всех национальностей) всегда выбирал самый тяжёлый, но и самый верный путь для преодаления очередной вселенской проблемы.
Всё просто, друзья мои. Мы просто в очередной раз доверились естественному отбору. Да, потери, возможно, будут не малыми, но нация после окончания работы природных механизмов однозначно станет в очередной раз сильнее...
Диалектика-с.
Хреново перевел.
Тут великая новость что все люди разные и по разному реагируют на всё. Не указано только, что по разному они реагируют на ВСЁ: на холод, на жару, на химикаты, на радиацию, а не только на диммерный набор атомов называемый "вирус CoViD-19"
Великие учоные за великие деньги сделали великое открытие... и продолжают наблюдение.
Похоже на то. "Дайте денег" и немного зауми. Уже писал но повторю. Здесь на АШ было размещено интервью нашего мэтра - вирусолога, который утверждал, что этот вирус нападает на клетки крови, в часности на гемоглобин. Он перестаёт переносить кислород и не совсем здоровые органы начинают страдать от удушья. Это обьясняет широкую гамму поражений у разных людей. А у крови ещё сушествуют разные клетки, группы и резусы, которые неравномерно распрелелены по всему миру и регионам мира. Я полагаю, что это гораздо ближе к истине, чем та заумь с намёками, в топике
Не совсем так - гемоглобин имеет положительный электрический заряд из-за железа в основе. В процессе "вирусной атаки" образуется много -ОН радикалов, которые забивают гемоглобин и не дают туда попасть кислороду.
-ОН радикалы образуются из-за распада воды и сахара, что добавляет проблем с густотой крови и, особенно диабетикам.
Это если внимательно слушать, что говорил Дедов Путину во время двух их встреч прошлым летом и зимой.
Он и говорил о железе, в том интервью
Возможно. Интервью я не видел, но мнение о том, что разрушается гемоглобин по интернетам бродит. Оно не верное в основе своей - гемоглобин на месте, но занят другим.
Да уж.. Всё ясно и понятно..
А о чем статья?
Блин тут для узких специалистов, наверное такие есть на этом сайте..
См. комментарий автора.
Как-то читала, что много кавказцев попадает в ковидники
Горцы тысячелетиями жили в природных резервациях (горных долинах). Кроме того, горный сухой воздух не способствует "лёгочным заболеваниям" и распространению микробов (мясо в горах сохнет). То есть, горцы менее всего адаптированы вк современным болезням.
В 30-х годах из горных долин Таджикистана жителей выселяли на равнины (на новые орошаемые земли). Смертность была высокой.
В феврале 2020-го сначала жахнуло в Иране и Армении, даже раньше чем в Европе, и надуло нам на Кавказ. Там по прямой недалеко совсем.
То есть хотели доказать что в группе риска жирные и/или старые и/или мужчины, а доказали, что в группе риска восточные азиаты?
Как я понял, есть немаленькая вероятность, что некоторые разновидности были направлены на разные расы или даже нации. И когда начнут очень быстро вымирать допустим, палестинцы, их соседи будут прикрываться версией, что это не вирус избирателен, а мы все привились, пока те не поймут, что это не совсем так. И так можно подставить кучу пар народов, которых слишком много и которые владеют какими-то полезными ресурсами.
Привился от Ковида весной. А 17 дней назад имел плотный контакт с больным Ковидом. Ехал с ним в его машине из Оренбурга в Соль-Илецк. Он заразился в Москве, но был уверен, отравился – расстройство КЖТ. А это первый признак индийского Ковида. В Соль-Илецке он заразил родителей. Ине повезло. Выдержал самоизоляцию (работал удалённо).
В соседнем доме (4 этажа 3 подъезда) умерло 3 человека. В другом (2 этажа, 3 подъезда) – тоже три. В нашем (4 этажа 3 подъезда) - 1. Все в возрасте.
А какие признаки, того, что "индийский" - это "ковид"?
Не понял вопроса. Индийский штамп Ковида характеризуется и расстройством желудочно-кишечного тракта. Но это мой диагноз. Диагноз врачей - Ковид.
Я не спец в инфекционной медицине, но подозреваю, что точно определить вирус можно только под электронным микроскопом и в специализированной лаборатории. Те же врачи тоже большинство диагнозов ставят по симптомам. Ну и тесты еще, с вероятностью 40 на 60.
Штамм. Раз пишешь статьи, то слова надо писать правильно.
Если писать с гуглоустройства, то и не такое можно написать ;)
Ну, тогда не стоит писать со смартов. Живет тут часть людей... Лучше бы чем поинтереснее занялись.
Перевод простой: "мы нихрена не знаем, используем метод "тыка" и хотим
понять что бы это значило"
и так можно догадаться с 3 раз ,что "хорошего" для русских там нет.
Разработчикам - не зачёт, мало вариантов тяжёлого течения.
Вот только не будет никакой адаптации популяции к Ковиду. Тупо потому что скорость размножения вирусов и, соотвественно, скорость адаптации их к чему-либо происходит на много порядков быстрее, чем адаптация человека к чему-либо.
Все эпидемии во все времена кончались одинаково: менее летальные варианты заболевания распространяются быстрее и вытесняют менее летальные (человек в маленьком ящичке уже ни с кем не общается и никого заразить не может).
Вопрос только в том, сколько народу успеет умереть, пока этот процесс завершится.
Во все времена объявлялся карантин, без права выхода за территорию. Для прокажённых строили специальные липрозории. А сейчас, при страшнейшей болезни не ограничивается перемещение не только внутри страны, но и за рубеж. Где логика?
Вы указали на механизм адаптации вирусов к людям. А в головном тексте в неявной форме - адаптация людей к вирусам.
А можно перевести на русский?
Можно исправить описку. Менее летальные штаммы со временем вытесняют более летальные.
Но более заразные варианты вирусов вытесняют менее заразные. Пример — дельта.
Так что в результате все идет к тому, что все будут тяжело болеть, распространяя заразу, возможно, оставаясь инвалидами, но умерать от заразы будем редко.
Вам нравится такая оптимальная с точки зрения вируса картина?
А причём тут “нравится” или “не нравится”? Других
писателейвирусов у меня для вас нет.Если бы вакцина защищала не на 90%-95%, а, скажем, на 99.9%, то можно было бы обсуждать варианты.
А то, что имеется сейчас — жизни спасти может (и за это всем, даже пресловутой биг фарме, большое спасибо), остановить эволюцию вируса — нет.
Собственно на Великобританию посмотрите — смертей очень мало, но заболевших масса, а значит адаптация вируса продолжается.
Опять это идиотское да-нет!!!!
Надёжная вакцина при удержании достаточного уровня иммунитета убивает вирус почти мгновенно. Следовательно, по сравнению с невакцинированными, она уменьшает вероятность появления мутантов на два, а то и три порядка.
Три порядка — это мало???
Для "нихрена не понял", есть люди особого риска тяжёлого течения короны. Врождённого. Чтобы это узнать, нужно делать генетический анализ, но это тоже не надёжно и оч. дорого. Проще привиться.Боитесь осложнений - не ешьте яйца, основной побочный эффект аллергические реакции, а вирусы растят в куриных яйцах.
В кратковременном плане "проще привиться". Этот вопрос не обсуждается. Но в дальней перспективе вирус "выбьет" тех, кто генетически предрасположен к тяжёлому протеканию болезни.
Из текста не понятно - какие гены входят в группу риска. Если это биологическое оружие, то это давно было понятно, что оно определенно направлено на какую то цель. И хотелось бы, если вы уже вникли в эту хитрую тему, что бы Вы перевели непонятные слова в понятные для всех выводы.
Смотрите "Комментарий автора".
Куда смотреть? - Какие этносы?
Я сам прожженный постмодернист - и понимаю смысл этого комментария, что - "какие то этносы вымрут"
Поэтому и вопрос - какие этносы в группе риска по смыслу из той страны?
Коряво написал. Поправил. Этносы не вымрут. В этносах вымрет разный процент людей.
тогда зачем
ведь понятно, что вирус неистребим в нашей популяции и либо колоться без продыху либо спокойно переболеть.
Российский эксперт на совещании с Президентом в прошлом году:
"Эта информация должна быть закрытой - фактически это карта нашей иммунологической национальной устойчивости".
Источник
Новость от 2020 года, когда предполагали, что ковид создан для азиатов.
Адаптация - да. А ещё есть вариант что вирус будет вполне успешно ликвидирован или элиминирован посредством вакцинирования. Сколько уже было всяких вариантов гриппов и т.п. ОРВИ? Куча. И где они сейчас все? Вот то то и оно.
И что? По вашему грипп и прочие ОРВИ "успешно элиминированы"? Исчезли из числа проблем человечества?
Не исчезли, но перешли в разряд менее опасных.
Почему же этого не случится с очередным ОРВИ?
Да. Ведь я имел в виду прежде всего те ОРВИ, которые появлялись вновь. Как нынешний коронавирус. Было много случаев различных новых вирусных инфекций - птичьи гриппы, свинячьи гриппы, верблюжьи вирусы, и т.д. и т.п. И где они сейчас? Вот и про нынешний коронавирус нужно будет взглянуть лет через 5 - может к тому времени он также останется только в воспоминаниях.
Да и смотреть ничего не нужно.
Коронавирусы (лат. Coronaviridae) — семейство РНК-содержащих вирусов, включающее на май 2020 года 43 вида, объединённых в два подсемейства.
Вот те, которые циркулируют в человеческой популяции.
HCoV-229E — альфакоронавирус, впервые выявлен в середине 1960-х годов (!!!);
HCoV-NL63 — альфакоронавирус, возбудитель был выявлен в Нидерландах в 2004 году;
HCoV-OC43 — бетакоронавирус A, возбудитель выявлен в 1967 году;
HCoV-HKU1 — бетакоронавирус A, возбудитель обнаружен в Гонконге в 2005 году;
SARS-CoV — бетакоронавирус B, возбудитель тяжёлого острого респираторного синдрома, первый случай заболевания которым был зарегистрирован в 2002 году;
MERS-CoV — бетакоронавирус C, возбудитель ближневосточного респираторного синдрома, вспышка которого произошла в 2015 году;
SARS-CoV-2 — бетакоронавирус B, выявленный во второй половине 2019 года.
В период с ноября 2002 года по июль 2003 года всего зарегистрировано 8096 случаев заболевания Тяжёлым острым респираторным синдромом (SARS) в 29 странах, умерли 774 человека. В 2004 году была ещё одна вспышка ОРВИ, связанная с медицинской лабораторией в Китае. Считается, что это произошло из-за того, что кто-то вступил в непосредственный контакт с образцом вируса атипичной пневмонии, а не в связи с передачей вируса человеку от человека или от животного. С 2004 года в мире не было зарегистрировано ни одного случая заболевания, вызванного SARS.
По состоянию на конец 2019 — начало 2020 годов в мире всего зарегистрировано от 2494 до 2506 случаев заболевания Ближневосточным респираторным синдромом (MERS), умерли от 862 до 912 человек.
Каким образом практически мало отличающийся от них вирус SARS-CoV-2 с меньшей контагиозностью и вирулентностью имеет летальность на несколько десятичных порядков больше?
Резюме.
1) Не существует определенного вируса SARS-CoV-2 (возбудителя covid-19). Это статистический фантом, собранный из обычной ситуации с ОРЗ, вызываемой различными коронавирусами (лат. Coronaviridae), циркулирующими в мире, как минимум, с 1960-х годов.
2) Данные о смертности от т.н. covid-19 многократно и злонамеренно преувеличены путем манипуляций с диагнозами и методами статистической обработки.
3) Данные о суммарном количестве смертей от т.н. covid-19 фактически получены путем приписывания к этому фантому - большей части смертей от ИНДП (Инфекции нижних дыхательных путей остаются четвертой ведущей причиной смертности в мире, при этом первой среди инфекционных болезней: в 2019 г. она составила 2,6 млн случаев).
4) Фактическая избыточная смертность в разных странах мира вызвана не фантомным covid-19, а локдауном и прочими "мерами борьбы с пандемией", которые привели к дисфункции экономики и социальной инфраструктуры (в т.ч. медицины).
5) Множество ложных ПЦР-тестов и странностей с новыми необычными штаммами, объясняется п.1. а также методически неправильным использованием ПЦР-тестов. Неработоспособность вакцин объясняется отчасти п.1., а отчасти - коммерческой торопливостью и технологической небрежностью при создании вакцин.
Сравните, например с этим:
"Гонконгский грипп может привести к следующим осложнениям: пневмония, миокардит, энцефалит и менингит а также обострять хронические заболевания сердца, астмы, сахарного диабета и др. В результате таких осложнений, даже после прекращения пандемии гриппа, продолжают умирать люди (так называемая дополнительная или избыточная смертность). После пандемии гонконгского гриппа, избыточная смертность от него наблюдалась ещё около 10 лет". (с)
А ещё имеется респираторно-синцитиальный вирус человека (Human orthopneumovirus), дающий все те же симптомы.
Страницы