Биоинформатика

Аватар пользователя Эпиграмма

Так приключилось, что своё среднее образование я получала в двух школах. Первая была в Гаграх и я там закончила только первый класс, а вторая в Ростове, где я и получила аттестат. Про первую я помню очень мало – там была очень красивая цветочная клумба перед главным входом с чёрными розами на ней и были очень высокие потолки с лепниной в классе, где я, возведя очи горе, исполняла на скрипке какие-то ужасные упражнения. Вторую школу я помню гораздо лучше. Никаких черных роз и никакой лепнины там не было – яблони-дички во дворе и обыкновенные белёные потолки в обычной типовой трёхэтажке буквой "Н".  Скрипка куда-то бесследно исчезла и ничто музыкальное мне не докучало до пятого класса, когда взамен скрипки откуда ни возьмись (из кустов, наверное) появилось пианино. 

Всяческих внеклассовых кружков в школе было множество – и танцев, и макраме, и классической борьбы, и немецкого языка, и авиамоделизма, и кройки и шитья, и фотодела, и кулинарии, и радиотехники, и стрельбы... На танцы и стрельбу я ходила, а на радиотехнику и немецкий – нет. И не ходила вовсе не потому, что мне было не интересно, а потому, что немецкий – мой второй родной, а на радиотехнике одни пацаны и ни одной девчонки. Не потому ли мой подход к биоинформатике получился и в жизни и в этом посте таким длинным?

Ну, да ладно.

В старших классах на уроках физики, где "про полупроводники", моё нехождение на радиокружок частично компенсировали и рассказали про всякие диоды, триоды, транзисторы, резисторы и прочие сопротивления.

А вчера включила я на ютюбе ролик с завлекательным для блондинок названием "Биоинформатика" и чуть с кровати не упала!

Там человек увлечённо рассказывал, какую огромную роль сыграли компьютеры в обработке и анализе данных в области генетики, о выявлении связей и закономерностей в этих данных, о расшифровке генома, как такового и называл всё это "биоинформатикой".

Не, ну а чё, вполне себе...

Обрабатываешь на компе с помощью эскуэля, питона, такой-то матери и спившегося выпускника геологического факультета Махачкалинского государственного юниверситета какие-то малочитабельные данные – вот уже и геоинформатика.

Сунул в комп для анализа массив текстов Пушкина Александра Сергеевича на предмет подсчёта гласных в глаголах – вот тебе и лингвоинформатика во всей красе.

А я-то, дура, всю жизнь при слове "биоинформатика" один школьный урок вспоминала, где нам рассказывали про "фотодиоды". Помните же? Приборчик такой придурошный, который, если на него свет светит, то он проводит электрический ток, а если не светит, не проводит. Ну, или наоборот, не суть.

Вот возьму я два таких фотодиода, расположу один в левом углу своего будуара, а другой в правом, подключу к ним всякие "измерялки" и доподлинно могу узнать, какой угол у меня светлее. Вроде бы, чего проще!? Но для того, чтобы придумать и сделать такие фотодиоды человечеству воооон сколько лет эволюции понадобилось – миллионы, если не миллиарды. Небось, когда моя прапра…прапращурица жила в пещере, у неё никаких фотодиодов не было и потому определить, какой угол её будуара светлей она могла только на глазок.

А вот и нет, ёклмн!

Я бы на её месте положила в своей пещере длинную колоду справа-налево, налила в неё водички, бросила туда щепотку сушеной ряски, а через неделю с не меньшей точностью, чем при наличии фотодиодов, могла бы сказать, какой угол светлее. Где больше ряски, тот и светлее. 

Вот это и есть "биоинформатика", я считаю.

Компьютер, на самом деле, ничего не считает, не анализирует, не постигает – ни НДС, ни связи нуклеотидов, ни вероятности залегания нефти, ни лингвистическую вооружённость Пушкина. Компьютер просто пропускает электрический ток по одному диоду в зависимости от состояния другого или не пропускает. Он состоит из миллионов и миллиардов определённым образом связанных ячеек.

В природе тоже всё состоит из миллионов-миллиардов определённо связанных ячеек, которые ведут себя статистически совершенно определённо. Это ли не компьютер? Нужно просто изучать его элементную базу и принципы её работы, чтобы "биоинформатика" на самом деле стала ею. А то ведь, если так дальше пойдёт, у нас и "танкоинформатика" станет наукой – в танчики-то вон сколько народу шпилится.

 

Авторство: 
Авторская работа / переводика
Комментарий автора: 

Из Педевикии:

Биоинформатика — совокупность методов и подходов, включающих в себя:

1. математические методы компьютерного анализа в сравнительной геномике (геномная биоинформатика);
2. разработку алгоритмов и программ для предсказания пространственной структуры биополимеров (структурная биоинформатика);
3. исследование стратегий, соответствующих вычислительных методологий, а также общее управление информационной сложности биологических систем.

Почти полжизни прожить и так разочароваться…

Комментарий редакции раздела Наземная живность

Одна из стороны вопроса - как то понимают люди

 

Комментарии

Аватар пользователя sasha7777
sasha7777(6 лет 7 месяцев)

Вот мне интересно, как бы я жил если у меня жена была бы такая ученая????laugh

Спасибо интересно.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

как бы я жил

Ну, если сам не дурак тоже со средним образованием, то интересно жил бы, я думаю)))

Аватар пользователя отпуск
отпуск(8 лет 1 неделя)

yes

в конце концов , не все же время мужики о бритвах и кремах беседуют, не правда ли7

Комментарий администрации:  
*** отключен (пропаганда и попытка оправдания измены Родине) ***
Аватар пользователя sasha7777
sasha7777(6 лет 7 месяцев)

Какое уж тут среднее образование,если жена такая ученая???? Курс ВУЗа за год бы прошел наверное.

Или же укрощение строптивойlaugh

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Или же укрощение строптивой

А чё там укрощать, если жинка с понятием? Она и сама сообразит, что лучше помалкивать, вовремя подносить пиво и варить борщ)))

А на самом деле я не знаю - нет у меня репрезентативных данных - по себе обо всех не судят. А вокруг чего только не насмотришься, хоть ученых, хоть нет

Аватар пользователя sasha7777
sasha7777(6 лет 7 месяцев)

laugh байки, а гордыня???? Вон брат женился, ели укротил. Я уже думал усе. И главное так грамотно по методике мозг выносит.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

по методике мозг выносит

В этом деле методичка - только помеха. У женщины способности к выносу мозга врожденные. И чем "врожденнее", тем бессмысленней и страшней))) Я тоже по брату (вернее, по его жене) сужу.

Аватар пользователя sasha7777
sasha7777(6 лет 7 месяцев)

Не тут как раз наша картина у нее ВУЗ причем сама, он распипи с техникумом.

Дошло до того что заставляла жилище продавать в деревне и в город уезжать. Для этой затеи обрубала его связи с близкими, и в бой.

Правда он мужик душевный,наш. Применил тактику самую действенную тактику борьбы с рационализмом. Уйдя в виртуальное пространство с помощью древних стимуляторов. И начал гонять...

Теперь все хорошо...

Аватар пользователя Dok-belarus
Dok-belarus(5 лет 3 месяца)

Вспомнил "курощение с дуракавалянием". Тоже симпатично.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

К своему стыду вынуждена сознаться, что термин "курощение с дуракавалянием" сейчас услышала впервые))) Полезла в и-нет (он же у нас всё знает), а там про это самое "курощение с дуракавалянием" вагон и маленькая тележка. Нужно будет просветиться мне по этой теме)))

Аватар пользователя Dok-belarus
Dok-belarus(5 лет 3 месяца)

Неужто мультик о Карлсона не видели?

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Так видела! Но не отложилось в голове про "курощение", хотя, когда слово увидела, то возникли какие-то смутные подозрения, что это мог быть Карлсон с курощением домомучительницы - всё-таки было, было  что-то такое в голове)))

Аватар пользователя Agejudge
Agejudge(6 лет 1 неделя)

Этого в мультике нет, это в книжке.

Комментарий администрации:  
*** отключен (неприемлемое общение) ***
Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Ну, вот всё и выяснилось))) Книжку про Карлсона я читала в глубоком детстве и в последствии не перечитывала. Мультик видела многажды в разные времена, потому и удивительно, почему про курощение всё так смутно? А теперь стало понятно.

Аватар пользователя Хмурый ослик
Хмурый ослик(8 лет 6 месяцев)

С учёной женой сложнее, но - интересней.
Там добавляется чисто женские нюансы в мышлении, но, как раз они часто помогают найти довольно интересные решения и ходы. Я - про "жизненные" трудности и ситуации, а - не про науку или инженерию. Туда милым дамам, всё же, путь - заказан! Из программирования я бы вообще выгонял насильно (вместе с миньеджерами и эйчарами, кто их взял). Но - НЕ из тестировщиков. Вот там, от женских особей - одна сплошная польза.

Комментарий администрации:  
*** отключен (систематические манипуляции и набросы) ***
Аватар пользователя sasha7777
sasha7777(6 лет 7 месяцев)

laugh Мож и так. Иди, Зульфия, иди....

Аватар пользователя AfterSockanuty
AfterSockanuty(7 лет 4 месяца)

Если такая то я бы удавилсяsmiley

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Возможно, это было бы и хорошо...cheeky

Аватар пользователя Бывший пенсионер

Попытки алгеброй понять гармонию осуществляются уже тысячелетиями и не смотря на все компьютеры воз не то, что не сдвинулся, но и похоже и отцепился.

Аватар пользователя Бывший пенсионер

Эпиграмма, Вы наверное еще и в том почему плохо сцепление у машины работает разбираетесь?!!!

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Нет, не разбираюсь. Могу лишь догадываться)))

 

Течет тосол, в машине неполадки,
Опять внутри стучит какой-то вал.
"Расточим всё и сменим вам прокладки!.." -
Серьезно глядя, слесарь мне  сказал!

И продолжал: "У вас совсем не тянет!
Не доводите до такого впредь!
Продуем всё! Мотор как новый станет!
Начнет переть, что любо посмотреть!"

Зашел назад: "Да это выхлоп разве?
С таким движком, какой у вас стоит,
Рычать должно, а этот только дразнит!
Принюхайтесь - не выхлоп, а иприт!"

Напарника позвал: "Дави педали!"
Еще один явился к нам на зов -
Пощупали, пожали и сказали:
"Да вы, мадам, совсем без тормозов!"

Все им не так и все им не угодно -
"Чихает", "детонирует", "троит".
Но под конец признали: "Тюнинг модный!
Довольно симпатичный внешний вид!"

Ну, слава богу! Много ли мне надо,
Чтоб стать счастливой в горестный момент -
Два мужика широкоплечих рядом
И хоть один какой-то комплимент!
 

Аватар пользователя ВладиславЛ
ВладиславЛ(5 лет 4 месяца)

"Это ли не компьютер?"

Это - нет. Но есть другие варианты.

Всего лишь моделирование простой части бактерии требует суперкомпьютера. Самое её поведение сложнее даже алгебраических вычислений.

 Куб со стороной 10м имеет мощь больше чем все компьютеры в мире. А океан?

Комментарий администрации:  
***отключен (антигосударственная пропаганда, систематические набросы) ***
Аватар пользователя Иннокентий Шниперсон

Петь на манер "Броня крепка и танки наши быстры..."

Комментарий администрации:  
*** Не желаю служить в армии! Пусть кто нибудь другой защитит мою тушку (https://aftershock.news/?q=comment/7236772#comment-7236772) ***
Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Ага, подходит)))

Аватар пользователя Nemoo
Nemoo(9 лет 9 месяцев)

Не измерить небольшую разницу в освещенности светодиодом. Фоторезистор надо, и омметр к нему. 

Хотя нет, извините, слазил в яндекс, почитал про фотодиоды. По памяти вспомнилось, что в зависимости от наличия или отсутствия света он либо открыт, либо закрыт.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Вот я сразу подумала, что если сравнивать, например, фотодиод и ряску, то сразу возникает вопрос - кто точнее, кто быстрее, у кого какие погрешности, у кого какие оптимальные диапазоны и т.д. Но это вопросы сплошь прикладные, а мы жеж о высоком, о концептуальном)))

Аватар пользователя Nemoo
Nemoo(9 лет 9 месяцев)

С фоторезистором и китайским мультиметром проще wink.

Приложил фр к щупам мультиметра, сходил в один угол, потом в другой.

Ну её, ряску эту. Жди, пока нарастёт. Потом, в том углу. который темнее, может оказаться просто теплее, и результат рясочных измерений окажется в корне неверным )

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

может оказаться просто теплее

Хех, света меньше, но теплее.... Сразу есть повод задумаццца, а не течет ли там за стенкой пещеры гейзер какой? Это ж "зеленое" отопление!

Аватар пользователя мужик-лапотник

Проще и быстрее всего с фотоэкспонометром. Можно в режиме падающего света, можно в режиме отражённого.

Интереснее всего - с фотоумножителем и осциллографом - там прямо видно как фотоны прибегают и на развёртке можно их прямо по их пичкам пересчитать, надо только диафрагму сделать из листа фольги с маленькой-маленькой  дырочкой от иголки посредине.

Аватар пользователя BlackHand
BlackHand(6 лет 1 месяц)

а мы жеж о высоком, о концептуальном)))

Об этом,что ли? wink

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Натягивание (а тут что-то другое) совы на глобус - любимая всехная забава. Среди малочисленных народов севера, типа чукчей, чухонцев и прочих мрачных финнов, забава имеет тенденцию к превращению в национальную, каковой давно является у англосаксов, пендосов и прочей демократической швали.

Аватар пользователя verner
verner(8 лет 6 месяцев)

Автор меня удивила. Даже продвинутые женщины не любят рассуждать о таких предметах.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

О-о-о, значит вы не читали тут на АШе моих ранешних бложиков)))

Даже продвинутые женщины не любят рассуждать о таких предметах

Дело не в "не любят". Дело в "не могут". Про продвинутых не знаю, но большинства мужчин это тоже касается, межпрочь)))

 

 

Аватар пользователя Зеб Стамп
Зеб Стамп(6 лет 2 месяца)

Где больше ряски, тот и светлее. 

Это пример использования биосенсоров. Это не биоинформатика.  

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Разумеется, не "биоинформатика", особенно если учесть ее определение, приведенное под постом.

И речь немножко не о биосенсорах, а о том, что информатика, как таковая, сегодня покоится на компьютерной (аппаратной) основе, а приставка "био" - это всего лишь пустое "украшательство" терпина. Я привела примеры "геоинформатики", "лингвоинформатики". Их можно миллион выдумать. Чем-нибудь они отличаются по сути, если отбросить приставку предметной области, где "информатика" используется?

"Биоинформатика" же в "моём" идеалистическом понимании - это разработка элементной базы каких-либо логическо-счетных (а лучше, мыслящих) устройств на биологической основе. Например, ИИ так пытаются разрабатывать, если говорить не об "квантовых" компьютерах. Мне кажется, это перспективнее, чем нечто не "био", потому как "био" компоненты могут быть использованы, как "черные ящики" с процессами внутри, которыми вы не занимаетесь, а занимаетесь лишь "входом и выходом". Этакая basic unput-output system - BIOS - жизнь))) 

Это долго рассказывать. Я поворачивающийся вслед за солнцем подсолнух не считаю унылым сенсором. Он гораздо сложнее и надежнее любой аналогичной "искусственной "следящей" системы, и вот его "биоинформатики" мы совсем не знаем.

 

Аватар пользователя mmx
mmx(8 лет 5 месяцев)

Я поворачивающийся вслед за солнцем подсолнух не считаю унылым сенсором. Он гораздо сложнее и надежнее любой аналогичной "искусственной "следящей" системы, и вот его "биоинформатики" мы совсем не знаем.

Подсолнух в теплице элементарно развернется вслед включенной лампочкой на потолке. Он такой же унылый как фотодиод smiley 

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Подсолнух в теплице элементарно развернется вслед включенной лампочкой

Правильно работает. Ну не вслед же уходящим тепличным китайцам разворачиваться)))

Аватар пользователя Зеб Стамп
Зеб Стамп(6 лет 2 месяца)

Биоинформатика - это исследование биологических систем и процессов с помощью информационных технологий. ИТ - устойчивое научное понятие. Ну, вот так оно к нам пришло.

ИТ-процессы, методы поиска, сбора, хранения, обработки, предоставления, распространения информации и способы осуществления таких процессов и методов; приёмы, способы и методы применения средств вычислительной техники при выполнении функций сбора, хранения, обработки, передачи и использования данных; ресурсы, необходимые для сбора, обработки, хранения и распространения информации. 

А то, что вы предлагаете -  встраивание биологической системы в сам вычислительный процесс (не на уровне сенсоров), больше походит на биокибернетику.  А если это встраивание будет на уровне элементной базы, то вот у них есть такой термин - компьютерный инжиниринг, и надо к нему будет присобачить приставку "био". Я только затрудняюсь сказать в каком месте должна быть эта приставка. Кажется, что от её положения смысл немного меняется: "биокомпьютерный инжиниринг" или "компьютерный биоинжинириг". Со стороны оба варианта выглядят, как страшная лажа.  

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Спасибо! Вот вы понимаете, над чем я исстрадалась, думая, что "биоинформатика" - это одно, а она оказалась совсем другим. Да, биокибернетика может спасти отца русской демократии меня)))

Аватар пользователя Зеб Стамп
Зеб Стамп(6 лет 2 месяца)

Рад оказаться полезным.

Аватар пользователя Психокартофель

Дилетантство на АШ пошло в атаку - бессмысленную и беспощадную)))

Учите молитвы Эпиграмма, там: думать, знать и принимать решения не надо вообще.

Комментарий администрации:  
*** Уличен в ретрансляции низкопробного шизоидного бреда - https://aftershock.news/?q=comment/9203796#comment-9203796 ***
Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Эта чивойта?

Пока в атаку идет лишь Психокартофель))) Высылайте текст молитв - буду учить. Наверняка, по по ним спец, раз раздаете непрошенные и дурацкие советы.

Аватар пользователя Gendolef белый
Gendolef белый(4 года 11 месяцев)

Ну вот он и спекся после биофотосинтеза. Одни глазки торчат во все щели ....

Аватар пользователя Agejudge
Agejudge(6 лет 1 неделя)

Да уж, не надо... Некоторым вообще вредно.

У меня дядька, после отсидки обмухлевывая меня в дурака, так же вещал: " Санек, карты - это тебе не шахматы, тут думать надо!"

Комментарий администрации:  
*** отключен (неприемлемое общение) ***
Аватар пользователя Bruno
Bruno(8 лет 7 месяцев)

Можно разрешить понятийный конфликт следующим образом: педевикии оставить биоинформатику, а википе а возможности ряски отнести к инфобионике.

Аватар пользователя Эпиграмма
Эпиграмма(7 лет 7 месяцев)

Конфликт бы разрешить конечно можно было бы, если бы я с Педевикией конфликтовала. Но нет, не конфликтую. Мы прекрасно уживаемся - я на ней паразитирую)))

Аватар пользователя Психокартофель

Мозговой паразит)))

Комментарий администрации:  
*** Уличен в ретрансляции низкопробного шизоидного бреда - https://aftershock.news/?q=comment/9203796#comment-9203796 ***
Скрытый комментарий Повелитель Ботов (без обсуждения)
Аватар пользователя Повелитель Ботов

Перспективный чат детектед! Сим повелеваю - внести запись в реестр самых обсуждаемых за последние 4 часа.

Комментарий администрации:  
*** Это легальный, годный бот ***
Аватар пользователя mmx
mmx(8 лет 5 месяцев)

Компьютер, на самом деле, ничего не считает, не анализирует, не постигает – ни НДС, ни связи нуклеотидов, ни вероятности залегания нефти, ни лингвистическую вооружённость Пушкина. Компьютер просто пропускает электрический ток по одному диоду в зависимости от состояния другого или не пропускает.

А как же механические компьютеры на шестеренках? А всякие пневматические и гидравлические? Нынче вон еще и квантовые какие-то выдумали... Компьютер это вычислитель, таким образом и человек-математик занимающийся любыми расчетами человек тоже компьютер. А математика - царица всех наук! У меня в школе такой плакат висел smiley

Аватар пользователя Психокартофель

Эпиграмма не математик она женщина 90-60-120)))

Комментарий администрации:  
*** Уличен в ретрансляции низкопробного шизоидного бреда - https://aftershock.news/?q=comment/9203796#comment-9203796 ***

Страницы