Возможно найден общий неизменяемый эпитоп S белка SARS-CoV-2

Аватар пользователя AnatolMV

Исследование опубликовано 18 Августа 2022г. в эл. журнале Nature.

Перевод Google Translate

Вызывающие озабоченность варианты SARS-CoV-2: анализ мутаций спайкового белка и эпитоп для широкой нейтрализации.

Независимо было показано, что мутации в шиповидных гликопротеинах вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 улучшают аспекты пригодности шиповидных белков. Здесь мы описываем фрагмент антитела (V Hab6), который нейтрализует все основные варианты, включая недавно появившиеся подварианты BA.1 и BA.2 Omicron, с уникальным способом связывания, выявленным в исследованиях крио-ЭМ. Кроме того, мы предоставляем сравнительный анализ мутационных эффектов в ранее возникших вариантных спайках и определяем структурную роль мутаций в NTD и RBD в уклонении от нейтрализации антител. Наш анализ показывает, что сильно мутировавший гамма-N-концевой домен демонстрирует значительные структурные перестройки, что частично объясняет его пониженную нейтрализацию реконвалесцентной сывороткой. Наши результаты дают представление о механизмах структурных, функциональных и антигенных последствий спайковых мутаций SARS-CoV-2 и подчеркивают уязвимость спайкового белка, которую можно использовать для обеспечения широкой защиты от циркулирующих вариантов.

Дальше введение с научными терминами со статьи:

 

Сама статья целиком тут.

https://www.nature.com/articles/s41467-022-32262-8

Авторство: 
Копия чужих материалов
Комментарий автора: 

т.е. получается, что переболевшие даже Уханьской версией, уже имеют T/B-клетки памяти к этим антителам и поэтому могут легче переносить любую версию короновируса.

А также, т.к. Спутник V использует ДНК S белка, то, соответственно, эти антитела на эти эпитопы тоже вырабатываются в организме после укола или вдыхания назальным способом.

В РФ началась назальная вакцинация СпутникV, начали использовать специальные насадки на обычный шприц:

Она сразу "убивает" основные аргументы антипрививочников: отсутствие первичного мукозального барьера, неконтролируемый S-белок в крови, возможные тромбозы из-за нарушения гомеостаза крови аденовирусом.

Задействование мукозального барьера очень важно, т.к. в этом случае вырабатываются антитела IgA на слизистой, которые могут находится в организме очень долгое время.

Отслеживать появление в реальном времени можно тут https://t.me/Sputnik_Nasal

Комментарий редакции раздела Вопросы здравоохранения

Статья проходная, научная.

Таких статей десятки тысяч за последние 3 года, посвященных различным исследованиям SARS-CoV-2.

Комментарий автора не логичен, из статьи эти выводы никак не следуют.

Комментарии

Аватар пользователя Мадж
Мадж(7 лет 10 месяцев)

ТБМ, слово "Корона" не запомнить?

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

А по существу, есть что написать?

Аватар пользователя Мадж
Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Я понял свою ошибку с буквой "а"  в слове "коронОАвирус", благодарю,  я убрал из названия упоминание о короне.

Аватар пользователя Ecelop111
Ecelop111(11 лет 2 месяца)

Я понял свою ошибку с буквой "а"  в слове "коронОАвирус"

а теперь поймите и другие свои ашипки.

в частности, что вирус ковид19 не выявлен и не выделен, его определяют по каким-то кускам генетического материала в кале в мазке из носоглотки поциента (упрощаю).

в организме человека живут тысячи и десятки тысяч вирусов и микробов, от кого те куски  - непонятно.

вирус НЕ ВЫДЕЛЕН, создана лишь его математическая модель, но вакцину сваяли.

от чего - от кусков генетического материала неведомого организма? может от вируса, может, от личинки Чужого.

 

Комментарий администрации:  
*** отключен (пропаганда, подсирание западу) ***
Аватар пользователя baltictea
baltictea(3 года 8 месяцев)

Я фото коронавируса в газетах видел, под электронном микроскопом его поймали.

Аватар пользователя kodwep
kodwep(1 год 9 месяцев)

ты видел просто фото с электронного микроскопа, не имея понятий, что там вообще. Я могу тебе таких же фото наделать без проблем.

Комментарий администрации:  
*** отключен (неинформативный срач, засирание эфира) ***
Аватар пользователя Рукастый
Рукастый(8 лет 3 недели)

Я могу тебе таких же фото наделать без проблем.

Так наделайте, чтобы их ученые выкладывали на своих сайтах. Потом расскажете. 

Комментарий администрации:  
*** Уличен в невменяемом хамстве - рекомендуется банить при рецидивах ***
Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Гуглите секвенирование и аппараты для этого. Хотя я облегчу Вам понимание

https://biomolecula.ru/articles/metody-v-kartinkakh-sekvenirovanie-nukleinovykh-kislot

Аватар пользователя СергиоПетров

Эти фотки очень похожи на места посадки аполонов на луне, я когда первый раз увидел места прилунения первым делом подумал, что это что-то под микроскопом рассматривали.

Комментарий администрации:  
*** отключен (систематический инфопонос и срач) ***
Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

И что? Взяли клетку с вирусом, секвенировали. Знаете такой механизм? А, я понял, Вам по старинке нужно под микроскопом живой вирус увидеть, чтобы он вам рожи корчил )))... Вирусы гриппа давно так исследуют... И чего тогда к вирусам гриппа у вас претензий нет? или есть?)))

в организме человека живут тысячи и десятки тысяч вирусов и микробов, от кого те куски  - непонятно.

Маленькая поправочка: они не живут в клетках ниже лимфослоя. Они живут на внешнем эпителии. Для секвенирования брали не мазок из носа или глотки. Для секвенирования брали, скорее всего, кусок из легких умершего человека в Италии. Или думаете в Италию РХБЗ РФ просто полить улицы раствором каталось?

Аватар пользователя Апокалипсикус

smile9.gif

При этом в США до ковида,самую быструю вакцину сваяли аж за пять годиков с тестированием.А тут сразу деньгов корпорациям захотелось, и после варки шмурдячка его сразу в ширнармассы внедрили, как экспериментальную,при этом тех кого кололи не предупреждали об этом..

  

Аватар пользователя apoptos
apoptos(7 лет 10 месяцев)

можно и по существу:
мукозальный барьер - не очень понятный термин, наверное было бы лучше сказать мукозальный иммунитет, местный иммунитет во входных воротах, а то мы так дойдем до кожного барьера

Вопрос, кроме антител, еще есть клеточный ответ, подскажите пожалуйста, кто-то где-то писал о формировании клеточного ответа к эс белку? (генериум разработал набор тиграспот кажется, наверное есть и другие аналоги за рубежом на основе элиспота)

Вопрос, как антитела помогают проникать вирусу в клетку, то есть ее инфицировать? (всем известный ADE)
2020, A perspective on potential antibody-dependent enhancement of SARS-CoV-2

И все таки, наверное ключевой вопрос, а как же антитела помогают уничтожить инфицированную клетку, которая "производит" тысячи, десятки тысяч, а может быть и сотни тысяч вирусных частиц?
 

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

 мукозальный барьер - не очень понятный термин, наверное было бы лучше сказать мукозальный иммунитет, местный иммунитет во входных воротах, а то мы так дойдем до кожного барьера

Согласен, просто для некоторых слово барьер понятнее, а так там есть и химический и механический и лимфоидные барьеры в механизме мукозального иммунитета.

Вопрос, как антитела помогают проникать вирусу в клетку, то есть ее инфицировать? (всем известный ADE)

ADE относится в основном к макрофагам. Дальше продолжать или разберётесь сами с основным механизмом ADE? У макрофагов нет нужных рецепторов для проникновения вируса. Теоретически возможно заражение макрофага в момент поглощения вируса. Но исследования летом-осенью в 2021 in vitro (в пробирке) показали что и этого нет COVID-19. Новых исследований я не видел пока, дадите ссылку если вы их видели?

Вопрос, кроме антител, еще есть клеточный ответ, подскажите пожалуйста, кто-то где-то писал о формировании клеточного ответа к эс белку?

Это классика иммунологии, можно сказать её основы. Вы какой клеточный ответ имеете в виду ,T-клеточный? Так это универсальный механизм, ему пофиг какие заражённые клетки убивать. Что к S белку после вакцины, что ко всем белкам ( S1/S2, N и т.д.) дикого вируса или бактерии. Вы вообще понимаете как этот механизм работает с момента попадания вируса или бактерии в организм?

 И все таки, наверное ключевой вопрос, а как же антитела помогают уничтожить инфицированную клетку, которая "производит" тысячи, десятки тысяч, а может быть и сотни тысяч вирусных частиц?

Это не задача антител, это задача NK и Т-киллеров. Задача антител прилипнуть к эпитопам вириона вируса ( не важно реплицированного или изначального) выполняя две задачи:

1.  Нарушить конфигурацию эпитопов (ключ к рецептору ACE2 клетки) что не даст вирусу слиться с здоровой клеткой.

2. Пометить вирион вируса для поглощения макрофагами M1 и уничтожения другими иммунными клетками.

Аватар пользователя testudo777
testudo777(4 года 3 месяца)

Спутник V использует ДНК S белка

Коронавирус относится к РНК-вирусам. О каком "ДНК S-белка" может вообще идти речь? smile3.gif

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Я ожидал Вашего появления ))

О том кусочке ДНК S-белка , который в аденовирус вставили вместо ДНК отвечающего за репликацию, после секвенирования РНК вируса. Дальше превратить его в  ДНК это дело техники. 

Аватар пользователя testudo777
testudo777(4 года 3 месяца)

О том кусочке ДНК S-​белка , который в аденовирус вставили вместо ДНК отвечающего за репликацию,

Ещё раз для альтернативно одарённого.

Коронавирус является РНК-вирусом. У него нет ДНК. Вообще нет. В том числе и "того кусочка ДНК S-белка", который, по вашему, куда-то "вставили" smile3.gif

 

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Коронавирус является РНК-вирусом. У него нет ДНК. Вообще нет. В том числе и "того кусочка ДНК S-белка", который, по вашему, куда-то "вставили" 

А я разве утверждал, что у коронавируса напрямую "отрезали" кусок с якобы ДНК S-белка? Где я это написал? Я написал про конечную конструкцию, а не про способ её построения.

Вы отрицаете возможность искусственного механизма преобразования в РНК S белка  в ДНК S белка после секвенирования РНК S-белка специальным аппаратом?

Аденовирус это ведь ДНК вирус, так? Значит логично туда вставлять чужой ДНК кусок. А затем эту векторную конструкцию размножить.

Аватар пользователя testudo777
testudo777(4 года 3 месяца)

Вы отрицаете возможность искусственного механизма преобразования в РНК S белка  в ДНК S белка

Вы это всерьёз?  Каким таким аппаратом проводилось секвенирование? smile3.gif

Кстати, полного секвенирования генома никто не провёл до сих пор.

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Вы отстали от современных достижений науки. Аппаратов полно. Какой использовало МО я понятия не имею ))

https://biomolecula.ru/articles/metody-v-kartinkakh-sekvenirovanie-nukleinovykh-kislot

Аватар пользователя testudo777
testudo777(4 года 3 месяца)

Что вы мне этот тупой высер журнаглистов толкаете?

Вы не ответили на вопрос об "аппарате" для секвенирования генома. smile3.gif

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Что вы мне этот тупой высер журнаглистов толкаете?

Вы даже не пролистали статью , не говоря уже о вдумчивом прочтении))) И даже не поинтересовались авторами.

Там есть аппараты и фирмы которые их производят. Доступа к мед. лабораториям МО, откуда в Гамалеи передали данные секвенирования после рейда РХБЗ РФ в Италию, я не имею ))) . Какой там аппарат стоит, мне тоже неизвестно.

Аватар пользователя testudo777
testudo777(4 года 3 месяца)

Вы совершенный дилетант в теме и, тем не менее, берётесь пропагандировать выдаваемый за вакцину препарат для внутриклеточной генной терапии. Хорошо ли эта ваша деятельность оплачивается? smile1.gif

В статье речь идёт не об "аппаратах", а о наборах для секвенирования.smile3.gif

 

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Так на этих наборах и построены аппараты, которые там представлены и упоминаются. И там отдельно есть про секвенирование РНК, оно появилось только в аппаратах нового 3-его поколения.

Секвенирование РНК (RNA-Seq), позволяющее оценивать экспрессию генов не только качественно, но и количественно. Существует возможность отдельно оценивать экспрессию кодирующих и регуляторных РНК. Данные методики направлены на изучение работы генома (активности его генов, в том числе генов-регуляторов) в разных клетках, тканях и органах.

Аватар пользователя Леонид Мешалкин

"Мы с мужем врачи - я педиатр, а он хирург. И в отпуске всем незнакомым людям говорим, что мы учителя биологии и физкультуры, иначе отдых будет испорчен выслушиванием всех жалоб и просьб о лечении. Познакомились с парой: она экономист, он инженер. Очень были удивлены, когда мы все встретились на медицинской конференции... " (ц)

Аватар пользователя СергиоПетров

 

на медицинской конференции..

я педиатр, а он хирург.

Стесняюсь спросить, а по поводу чего конференция была?

Комментарий администрации:  
*** отключен (систематический инфопонос и срач) ***
Аватар пользователя Леонид Мешалкин

Это цитата

 

Аватар пользователя stop
stop(2 года 10 месяцев)

Ничего не получается.

Раз сказали "ковидные паспорта", значит вакцинируем, цыфруем и биометрируем.

А кому не нравится - вот ещё оспьпу можно придумать.

(А "переболевшие" - это некошерно)

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

В РФ уже месяц как началась назальная вакцинация СпутникомV двумя компонентами. Что Вы против назального варианта имеете против?

Ведь она сразу убивает основные аргументы антипрививочников: отсутствие первичного мукозального барьера, неконтролируемый S-белок в крови, возможные тромбозы из-за нарушения гомеостаза крови аденовирусом.

Аватар пользователя eprst
eprst(12 лет 1 месяц)

СпутникV всем хорош. Можно применить и для анальной вакцинации, а можно и втирать до полного удовлетворения. Некоторым втирают в мозг и они получают просветление.

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Что аргументов против не осталось? Cтрадай теперь. Страданием антипрививочника удовлетворен.

Аватар пользователя eprst
eprst(12 лет 1 месяц)

Какие страдания? Вы о чём? Злорадное наблюдение со стороны.

Аватар пользователя Кондрат.
Кондрат.(5 лет 3 месяца)

У вас опыт?

Аватар пользователя eprst
eprst(12 лет 1 месяц)

Избежал и не планирую вляпываться.

Аватар пользователя Кондрат.
Кондрат.(5 лет 3 месяца)

тогда откуда такая уверенность?

Аватар пользователя eprst
eprst(12 лет 1 месяц)

Загадочный вы наш. 

Аватар пользователя Галина ГБ
Галина ГБ(2 года 6 месяцев)

Анатолий, спасибо за ссылку и комментарии. Я доверяю Вашему анализу и тем дисскуссиям, которые велись в 2020-2021 Вами на эту тему. Когда прошлым летом муж слег с температурой 39 больше пяти дней, а мы с дочерью находясь с ним круглые сутки болели в лёгкой форме (без пневмонии и высокой температуры), было стойкое убеждение, что мы с этой заразой раньше встречались. А муж только в прошлом году, и похоже, сразу с Дельтой.

В общем, новости хорошие. Болеть будем и дальше, но помереть уже больше не должныsmile7.gif.

 

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Пожалуйста. Думаю так и дальше будет.

Аватар пользователя stop
stop(2 года 10 месяцев)

А мне просто интересно(по спутнику), как размножается в товарных количествах неразмножаемый генномодифицированный аденовирус.

И вообще, судя по принимаемым мерам дело не в вирусе, и не в "пандемии", а в формировании некоторой "цыфровизации" населения.

Причем в этой цыфровизации как-бы и ничего плохого и не предполагается.

Но вот сопутствующие тонны манипуляций с информацией, пропаганы, ухода от темы и даже откровенной порой лжи(это не про конкретно эту статью) наводит на некоторые подозрения.

Вот и давайте отделять "мух от котлетов" -- медицину от пропаганды, переболевших и вообще имеющих иммунитет от "антипрививочников", и пандемию(если она действительно имеет место) от цыфровизационной бюрократии.

Мне по барабану назальная она, или там ректальная, если это оправдано медицинскими показаниями.

И не против биометрий с цыфровизациями, если это не принесет ухудшения моего(личного и семейного) социального и экономического положения.

Но раз начинается "юлить" - то значит это не так.

 

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

А мне просто интересно(по спутнику), как размножается в товарных количествах неразмножаемый генномодифицированный аденовирус.

У Вас есть доказательства, что аденовирус вакцины размножается в организме? Без ДНК отвечающей за воспроизведение? Интересен очень механизм такого размножения. Прям непорочное зачатие получается. )))  

Аватар пользователя stop
stop(2 года 10 месяцев)

У меня есть "осознанное согласие".

Согласно которому доказательства должны наоборот мне предоставлены.

А не заявления некоторорых далёких от биологии личностей о "непорочном" производстве этой вакцины в баках частной лаборатории.

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Ну и чем это будет отличатся, если вы заболеете обычным размножаемым Ad5 или Ad26 без вставки ДНК S-белка? Вы поймите, наша иммунная защита многоуровневая. Она в любом случае работает. Просто проблема в скорости первичного иммунного ответа организма.

Иммунным клеткам первично нужно пройти множественный положительный и отрицательный отбор на совместимость со всеми рецепторами-белками собственного организма, а это время, которое ни от чего не зависит и ускорить его никак нельзя, к сожалению.

Или Вы опасаетесь, что можно генномодифицировать дикий аденовирус до того варианта, что он еще быстрее будет размножаться? Я вас огорчу - этот механизм внутри N-белка тела вируса надо менять годами, даже искусственно в лабораториях.

Аватар пользователя pvz
pvz(8 лет 11 месяцев)

Вот и давайте отделять "мух от котлетов" -- медицину от пропаганды

Самый умный что ли?! Пару раз палкой по башке, обездвижить и колоть.

Аватар пользователя stop
stop(2 года 10 месяцев)

Вот даже "палкой" в некоторой степени можно "понять и простить".

Но ведь эта пропаганда заявляет о "добровольном" причастии.

Аватар пользователя pvz
pvz(8 лет 11 месяцев)

Именно!

Потому что важен факт добровольной отдачи себя в руки новых хозяев, иначе не считается. Душу можно купить, но нельзя украсть или отнять.

Аватар пользователя krabus
krabus(7 лет 9 месяцев)

Фига сё, Вы загнули. Размножение(производство) неразмножаемого генномодифицированного вируса и есть то ноу-хау, которое является не просто коммерческим секретом Гинцбурга, а Государственной тайной РФ. Без стеба. 

Аватар пользователя kodwep
kodwep(1 год 9 месяцев)

Что Вы против назального варианта имеете против?

Ничего, просто твой ковидный высер никому тут не интересен, спектакль уже давно закончен, в феврале.

Комментарий администрации:  
*** отключен (неинформативный срач, засирание эфира) ***
Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

За себя отвечай, а не за других.

Аватар пользователя Aleksey2018
Aleksey2018(6 лет 4 месяца)

Не совсем видимо закончен. Опять начали истерику устраивать. Маски начинают вводить. И автор один из винтиков этого механизма. На Конте тоже вылез из спячки Амбрелла с продвижением истерии.

Аватар пользователя AnatolMV
AnatolMV(5 лет 11 месяцев)

Интересно, как инженер КТВ может быть причастен к этому вот всему. ))) Я опубликовал новость, которая объясняет все вопросы что были ранее, даже у меня когда я начал поверхностно изучать тему иммунологии.

Если это правда, то это шаг к стерилизующему вирус естественному природному механизму человека.  За что так и выступают отрицатели использования СпутникаV. Маски, согласен, вводить снова не надо. Смысла нет.

Но админресурс на местах в регионах мне не подчиняется. ))

Страницы